More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6858 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6858  GrpE protein  100 
 
 		 312 aa  613  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0571011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1772  GrpE protein  40.28 
 
 		 208 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0802801  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2160  GrpE protein  40.71 
 
 		 212 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  38.35 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  36.53 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  35.11 
 
 		 206 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2068  GrpE protein  38.19 
 
 		 212 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.84065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2045  GrpE protein  36.36 
 
 		 221 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0137125 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  35.44 
 
 		 190 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  36 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2372  GrpE protein  35.71 
 
 		 201 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.919254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  32.06 
 
 		 174 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 		 199 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  36.55 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  35.8 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2133  HSP70 family protein GrpE  30.85 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0603928  normal  0.40294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  30.82 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  30.05 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  35.19 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  32.78 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  32.96 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  43.12 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  31.71 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 		 206 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 		 206 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  34.88 
 
 		 181 aa  75.1  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 		 206 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  35.37 
 
 		 206 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  32.05 
 
 		 192 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  37.27 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  34.62 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  35.96 
 
 		 194 aa  74.7  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  35.15 
 
 		 208 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  34.76 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  37.58 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1196  GrpE protein  29.89 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  28.8 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  35.11 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  36.02 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  34.57 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  34.15 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  33.74 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  34.35 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  33.14 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  29.41 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  36.88 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  31.06 
 
 		 185 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  33.59 
 
 		 195 aa  72  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  32.61 
 
 		 198 aa  72  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  30.14 
 
 		 195 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  35.19 
 
 		 208 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  30.18 
 
 		 194 aa  71.6  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  34.15 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  32.76 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  31.3 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  28.96 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  32.41 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 		 209 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0648  GrpE protein  38.3 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  34.84 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2457  GrpE protein  31.58 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.23302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  38.05 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  29.24 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  33.58 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.76 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  33.59 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  31.25 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  33.58 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  33.59 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  34.07 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  34.15 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3684  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000160031  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  31.79 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2165  GrpE protein  35.61 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.281053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  30.17 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  33.58 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  33.54 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  33.54 
 
 		 195 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  32.84 
 
 		 209 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  31.54 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  31.96 
 
 		 187 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  33.33 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  32.93 
 
 		 188 aa  67.8  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  34.57 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  35.92 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  31.03 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  33.33 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  30.23 
 
 		 225 aa  67  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  29.17 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  30.18 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  34.07 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  31.06 
 
 		 189 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  28.06 
 
 		 200 aa  67  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  32.28 
 
 		 203 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  30.18 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  35.56 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  30.18 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>