More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1692 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  61.84 
 
 		 207 aa  241  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  54.13 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0853  GrpE protein  60.71 
 
 		 188 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000644749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  65.41 
 
 		 198 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  56.82 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  54.29 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  34.39 
 
 		 226 aa  99  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  33.33 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  36.24 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  37.27 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  36.48 
 
 		 212 aa  94.7  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.3 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  35.44 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  37.67 
 
 		 226 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  33.68 
 
 		 200 aa  91.3  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  32.97 
 
 		 190 aa  91.3  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1347  GrpE protein  31.79 
 
 		 150 aa  91.3  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.966336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  30.35 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  30.77 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  35.44 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  36.36 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  35.33 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  34.48 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  33.73 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  33.1 
 
 		 173 aa  89.4  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.84 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  32.68 
 
 		 179 aa  88.6  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  34.42 
 
 		 185 aa  87.8  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2473  protein GrpE (heat shock protein)  37.11 
 
 		 194 aa  88.2  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  34.29 
 
 		 202 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  33.76 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  33.91 
 
 		 260 aa  87.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  33.73 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  33.33 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  29.52 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  33.53 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  32.97 
 
 		 217 aa  86.7  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  37.24 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  33.88 
 
 		 187 aa  87  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.95 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  33.54 
 
 		 230 aa  85.5  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  32.5 
 
 		 282 aa  85.5  5e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  35.71 
 
 		 186 aa  85.5  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  32.12 
 
 		 201 aa  85.5  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  32.65 
 
 		 207 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 		 188 aa  85.1  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  33.54 
 
 		 230 aa  84.7  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  28.43 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  33.1 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  34.97 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2766  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000506874  normal  0.0900785 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  32.17 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  31.71 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  29.07 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  34.21 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02502  heat shock protein  36.31 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000506013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  33.1 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3853  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000510847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2772  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  5.080719999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1070  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  0.0707842 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  29.21 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  30.77 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  34.22 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2898  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000538048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3002  heat shock protein GrpE  36.31 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.86694e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02466  hypothetical protein  36.31 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000587917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1061  Ribulose-phosphate 3-epimerase  35.75 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000037652  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  34.73 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  32.89 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  31.05 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1004  heat shock protein GrpE  34.83 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.324391 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  28.32 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  31.71 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  34.12 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  32 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  34.39 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  34.3 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  32.59 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  33.57 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  29.21 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08251  GrpE protein (Hsp-70 cofactor)  35.37 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  34.64 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  31.82 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  31.82 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0869  GrpE protein  32.47 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.555049  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  36.6 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  33.33 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  31.06 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  32.95 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  28.57 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  36.2 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>