More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1488 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  100 
 
 
198 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  60.54 
 
 
207 aa  227  8e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  68.79 
 
 
207 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  64.38 
 
 
215 aa  218  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  65.41 
 
 
209 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  52.33 
 
 
206 aa  200  9e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0853  GrpE protein  55.8 
 
 
188 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000644749  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.86 
 
 
207 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  39.38 
 
 
228 aa  107  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  39.61 
 
 
201 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  39.44 
 
 
226 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  38.26 
 
 
210 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  36.57 
 
 
190 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  35.06 
 
 
208 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  39.04 
 
 
204 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  36.97 
 
 
230 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  36.49 
 
 
210 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  36.97 
 
 
230 aa  99.8  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  38.46 
 
 
202 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  37.59 
 
 
198 aa  99.8  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.46 
 
 
202 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  36.69 
 
 
260 aa  99.4  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1347  GrpE protein  34.44 
 
 
150 aa  98.6  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.966336  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.44 
 
 
204 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  35.06 
 
 
181 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.03 
 
 
217 aa  97.1  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  37.32 
 
 
202 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  33.33 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  34.39 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  34.42 
 
 
185 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  37.11 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  33.16 
 
 
206 aa  95.5  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  39.33 
 
 
187 aa  94.7  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  32.3 
 
 
282 aa  94  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  32.14 
 
 
179 aa  93.6  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  38.46 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  37.5 
 
 
194 aa  92  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  33.68 
 
 
189 aa  92  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  33.72 
 
 
208 aa  91.7  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  35.59 
 
 
200 aa  91.3  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  36.05 
 
 
222 aa  90.5  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  34.81 
 
 
210 aa  90.5  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  32.88 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  37.59 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  34.18 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  37.43 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  34.69 
 
 
222 aa  89.7  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  36.76 
 
 
224 aa  89.4  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  33.12 
 
 
213 aa  89  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  36.17 
 
 
206 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  36.55 
 
 
181 aa  89  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  31.98 
 
 
210 aa  87  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  37.06 
 
 
206 aa  87  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  37.76 
 
 
213 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  30.16 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  38.52 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  36.43 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  31.18 
 
 
211 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  33.33 
 
 
187 aa  86.3  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  34.81 
 
 
231 aa  85.9  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  32.02 
 
 
226 aa  85.5  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  36.76 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  33.33 
 
 
204 aa  85.1  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  32.57 
 
 
181 aa  85.1  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  32.14 
 
 
193 aa  84.7  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  35.62 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  32 
 
 
225 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  37.5 
 
 
186 aa  84.3  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  30.82 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  32.14 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  35.07 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  35.14 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  29.17 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0936  heat shock protein GrpE  37.5 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0941203  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  40.4 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  29.89 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  35.12 
 
 
261 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  35.12 
 
 
261 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  31.65 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 
198 aa  81.3  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  31.88 
 
 
243 aa  81.3  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  30.2 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  35 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  33.92 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  32.92 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  31.25 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  33.12 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  29.41 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1120  co-chaperone GrpE  32.79 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0675757  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0627  co-chaperone protein GrpE  34.97 
 
 
247 aa  79  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0327836  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  33.92 
 
 
200 aa  79  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  36.96 
 
 
195 aa  79  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  28.81 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  32.5 
 
 
212 aa  77.8  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  32.31 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  32.9 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  32.35 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  32.48 
 
 
195 aa  77.8  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  34.44 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  36.36 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>