More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1614 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  100 
 
 		 175 aa  357  5e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  70 
 
 		 162 aa  233  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  42.95 
 
 		 213 aa  124  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  39.61 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  39.47 
 
 		 195 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  37.43 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  40.25 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  37.25 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  36.31 
 
 		 226 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  36.94 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  39.24 
 
 		 231 aa  104  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  40.3 
 
 		 208 aa  104  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  37.82 
 
 		 213 aa  103  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  38.41 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  38.41 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  37.21 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  37.21 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  37.21 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  37.21 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  37.21 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  35.98 
 
 		 246 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  34.67 
 
 		 194 aa  98.2  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  35.71 
 
 		 248 aa  97.8  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  36.43 
 
 		 188 aa  97.8  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  36.43 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  36.43 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  36.43 
 
 		 198 aa  96.3  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  39.63 
 
 		 215 aa  95.9  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  33.55 
 
 		 206 aa  95.5  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  36.47 
 
 		 274 aa  95.5  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  31.85 
 
 		 192 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  31.85 
 
 		 192 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  37.11 
 
 		 221 aa  94.4  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  33.77 
 
 		 178 aa  94  9e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  35.62 
 
 		 180 aa  93.6  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  39.84 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  34.67 
 
 		 207 aa  92  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  36.57 
 
 		 189 aa  92  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  39.26 
 
 		 239 aa  91.7  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  33.58 
 
 		 210 aa  91.7  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  34.44 
 
 		 181 aa  90.9  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  34.69 
 
 		 156 aa  90.9  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  38.52 
 
 		 239 aa  90.5  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  36.15 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  30.6 
 
 		 198 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  28.76 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  33.92 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  35.48 
 
 		 172 aa  89.4  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  38.1 
 
 		 206 aa  89  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  35.67 
 
 		 242 aa  88.6  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  33.53 
 
 		 223 aa  88.2  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  34.73 
 
 		 172 aa  88.2  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  31.29 
 
 		 208 aa  87.8  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  31.29 
 
 		 208 aa  87.8  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  36.92 
 
 		 239 aa  87.8  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  36.42 
 
 		 207 aa  87.4  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  33.58 
 
 		 181 aa  87.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  29.17 
 
 		 200 aa  87.4  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  36.23 
 
 		 247 aa  87.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  30.11 
 
 		 217 aa  87  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  34.18 
 
 		 225 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  35.03 
 
 		 207 aa  86.3  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  30.99 
 
 		 185 aa  85.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  31.18 
 
 		 197 aa  85.9  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  32.93 
 
 		 204 aa  85.1  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  37.67 
 
 		 204 aa  85.5  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  33.99 
 
 		 184 aa  85.1  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  38.21 
 
 		 169 aa  84.7  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  28.31 
 
 		 211 aa  84.7  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1477  GrpE protein  29.56 
 
 		 240 aa  84.7  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  39.2 
 
 		 178 aa  84.7  7e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  34.09 
 
 		 201 aa  84.3  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  32.37 
 
 		 259 aa  84  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  34.85 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  36.23 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  30.6 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0129  GrpE protein  33.86 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  34.38 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  36 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  32.09 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  36.36 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  33.58 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  32.3 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  36.51 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  30.49 
 
 		 261 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  30.49 
 
 		 261 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  36.22 
 
 		 243 aa  81.6  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  31.03 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  32.26 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  26.32 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  31.5 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  28.21 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1243  GrpE protein  35.12 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.847683  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4475  GrpE protein  31.71 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323495  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  31.41 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  34.13 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  33.81 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  32.31 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  32.34 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  31.87 
 
 		 282 aa  77.4  0.00000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>