More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10356 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  100 
 
 
235 aa  463  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  67.03 
 
 
215 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  67.03 
 
 
215 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  67.03 
 
 
209 aa  234  9e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  67.03 
 
 
215 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  65.75 
 
 
205 aa  230  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  66.18 
 
 
199 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  49.51 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  46.6 
 
 
217 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  42.86 
 
 
235 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  44.62 
 
 
193 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  41.58 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  53.03 
 
 
265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  44.15 
 
 
240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  51.52 
 
 
299 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  42.01 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  50.77 
 
 
298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  42.86 
 
 
193 aa  128  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  42.26 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  39.91 
 
 
217 aa  126  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  39.17 
 
 
224 aa  122  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  44.87 
 
 
267 aa  121  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  38.38 
 
 
228 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  37.5 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  36.7 
 
 
222 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  38.3 
 
 
199 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  40.19 
 
 
209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  42.54 
 
 
212 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  38.71 
 
 
220 aa  112  7.000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  44.68 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.5 
 
 
264 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  42.86 
 
 
222 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  42.65 
 
 
232 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  42.5 
 
 
188 aa  97.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  39.2 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  34.83 
 
 
206 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  37.4 
 
 
232 aa  94.7  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.58 
 
 
208 aa  94  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  37.06 
 
 
242 aa  92.4  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  37.69 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  40.77 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  34.31 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  31.36 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  37.12 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  39.86 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  35.33 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  38.51 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  33.09 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  31.85 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  33.33 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  31.85 
 
 
259 aa  79  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  34.65 
 
 
261 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  34.65 
 
 
261 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  36.18 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  32.81 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  34.62 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  33.82 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  33.82 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  33.96 
 
 
194 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  31.55 
 
 
204 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1961  GrpE protein  38.24 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.388028  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  35.48 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  35.48 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  32.1 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  33.15 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0621  GrpE protein  38.35 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000112666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  34.84 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  34.44 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  32.35 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  32.72 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  35.95 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  38.57 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  33.33 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  38.1 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  30.53 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  32.89 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  35.16 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  32.31 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0529  co-chaperone GrpE  29.3 
 
 
187 aa  71.2  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.914773  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  34.62 
 
 
200 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  35.06 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  37.5 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  36.43 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  35.71 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  32.62 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  35.77 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  28.57 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  35.38 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  31.06 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2014  GrpE protein  33.14 
 
 
361 aa  68.9  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  34.72 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  33.59 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0627  co-chaperone protein GrpE  35.44 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0327836  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  30.11 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>