More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0487 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0487  GrpE protein  100 
 
 		 199 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.204173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0259  GrpE protein  58.79 
 
 		 205 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0957161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0450  GrpE protein  51.31 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0463  GrpE protein  60.28 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.214185  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0474  GrpE protein  60.28 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0635  GrpE protein  50.77 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.579743  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10356  heat shock protein GrpE  65.65 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.202189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4269  GrpE protein  53.9 
 
 		 214 aa  160  9e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  45.3 
 
 		 265 aa  136  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  52.94 
 
 		 299 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  46.99 
 
 		 217 aa  127  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0365  GrpE protein  47.5 
 
 		 298 aa  127  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  43.75 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4806  GrpE protein  51.32 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  46.79 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  52.7 
 
 		 261 aa  112  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.312052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0246  GrpE protein  44.78 
 
 		 240 aa  112  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2116  GrpE protein  47.37 
 
 		 267 aa  112  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0346149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4353  GrpE protein  41.81 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18800  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  43.78 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00738423  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4232  GrpE protein  44.74 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.997886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  45.65 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5217  GrpE protein  54.01 
 
 		 232 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4362  GrpE protein  42.03 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710081  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0350  GrpE protein  44.63 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.851943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  39.31 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.19805  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5470  GrpE protein  42.48 
 
 		 250 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.958521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0202  GrpE protein  43.48 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00258444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3807  GrpE protein  39.08 
 
 		 228 aa  101  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3620  GrpE protein  43.59 
 
 		 222 aa  101  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0197  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  45 
 
 		 264 aa  99.8  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.135076  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04430  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  43.33 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.231715 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0441  GrpE protein  39.26 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  31.67 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  35.79 
 
 		 207 aa  91.3  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1281  co-chaperone GrpE  38.13 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  34.19 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  32.12 
 
 		 248 aa  89.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  33.17 
 
 		 223 aa  89.4  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1312  heat shock protein GrpE  37.12 
 
 		 218 aa  89.4  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  31.82 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3708  GrpE protein  35.98 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.500996 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  34.46 
 
 		 224 aa  85.1  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3590  GrpE protein  37.2 
 
 		 177 aa  85.1  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00352283  normal  0.0900367 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  30.96 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0232  GrpE protein  39.56 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.284998  normal  0.283245 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  30.29 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  30.06 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05500  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.59 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  36.51 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  30.77 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  34.97 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0799  GrpE protein  34.74 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  38.28 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0095  GrpE protein  33.56 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.266913 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  35.1 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1961  GrpE protein  37.88 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.388028  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  31.61 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  32.82 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  35.77 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  28.57 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  30.43 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  35.71 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  34.08 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  33.53 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  32.19 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  31.78 
 
 		 239 aa  74.7  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  34.64 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  35.07 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  30.23 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  33.33 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  29.51 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  31.01 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  36.03 
 
 		 261 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  36.03 
 
 		 261 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  32.09 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3434  heat shock protein GrpE  32.37 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398988  normal  0.0620931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  32.03 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  33.97 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2077  GrpE protein  35.07 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0309  GrpE protein  33.33 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  31.86 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0077  GrpE protein  30.38 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0763151  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  32.92 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  32.56 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  34.59 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  30.81 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00570  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  37.59 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  36.92 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00151  heat shock protein GrpE  29.46 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  36.64 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  33.85 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  30.38 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  31.41 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  33.81 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  33.71 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  34.43 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  32.56 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  35.71 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  32.4 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>