More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0439 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0439  GrpE protein  100 
 
 
171 aa  347  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00290609  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  50.67 
 
 
202 aa  159  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  52.63 
 
 
204 aa  150  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3461  GrpE protein  51.32 
 
 
204 aa  144  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.704807  normal  0.0101104 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  48.46 
 
 
201 aa  120  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  39.63 
 
 
204 aa  117  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  38.89 
 
 
187 aa  114  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  40 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  40.13 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  41.48 
 
 
225 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  42.07 
 
 
192 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  39.61 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  38.31 
 
 
274 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  38.67 
 
 
248 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0764  GrpE protein  38.1 
 
 
187 aa  106  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  34.64 
 
 
213 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  35.33 
 
 
210 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  39.75 
 
 
231 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  38.16 
 
 
208 aa  101  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  35.33 
 
 
223 aa  101  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  35.26 
 
 
188 aa  101  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  34.36 
 
 
188 aa  100  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  34.36 
 
 
188 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  34.36 
 
 
188 aa  100  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  34.36 
 
 
188 aa  100  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  34.36 
 
 
188 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  34.36 
 
 
188 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  34.36 
 
 
188 aa  100  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2058  GrpE protein  35.67 
 
 
194 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  34.64 
 
 
181 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  36.67 
 
 
246 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  38.67 
 
 
213 aa  98.6  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  31.95 
 
 
226 aa  98.2  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1579  GrpE protein  36.6 
 
 
184 aa  98.2  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.524247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  33.97 
 
 
198 aa  97.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  32.52 
 
 
192 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  33.92 
 
 
259 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  34.13 
 
 
259 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1025  heat shock protein GrpE  36.54 
 
 
194 aa  96.3  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2312  GrpE protein  31.39 
 
 
224 aa  96.3  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000737606  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  34.42 
 
 
210 aa  95.9  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  35.76 
 
 
192 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  34.21 
 
 
225 aa  95.1  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  36.62 
 
 
210 aa  94.7  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  32.89 
 
 
206 aa  94  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1035  GrpE protein  37.16 
 
 
189 aa  94.4  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00038029  hitchhiker  0.000654048 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  32.24 
 
 
195 aa  94  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  35.71 
 
 
204 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  38.57 
 
 
179 aa  94  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  34.5 
 
 
242 aa  93.6  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  35.86 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  36.48 
 
 
260 aa  92.8  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  35.54 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  34.27 
 
 
185 aa  92  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  34.32 
 
 
221 aa  92  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  32.35 
 
 
239 aa  92.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  33.33 
 
 
247 aa  92.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0237  GrpE protein  35.44 
 
 
218 aa  92.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  37.06 
 
 
207 aa  91.7  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  32.78 
 
 
180 aa  91.7  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  32.14 
 
 
239 aa  91.3  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  34.1 
 
 
197 aa  90.9  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  35.81 
 
 
173 aa  90.9  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0082  GrpE protein  37.09 
 
 
222 aa  90.5  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  32.52 
 
 
208 aa  90.5  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  32.52 
 
 
208 aa  90.5  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1053  GrpE protein  38.31 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  36.21 
 
 
200 aa  90.1  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0212  GrpE protein  37.25 
 
 
184 aa  89.4  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.915727 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  34.01 
 
 
208 aa  89  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0114  GrpE protein  32.03 
 
 
265 aa  88.6  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.750568  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0621  GrpE protein  40.46 
 
 
189 aa  88.2  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000112666  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0304  GrpE protein  35.1 
 
 
195 aa  87.8  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2881  GrpE protein  31.21 
 
 
181 aa  87.4  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.274349  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  33.52 
 
 
181 aa  87.4  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  30 
 
 
239 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  31.93 
 
 
181 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1614  GrpE protein  34.34 
 
 
175 aa  87  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.245406  normal  0.537343 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  32.65 
 
 
208 aa  87  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1090  co-chaperone GrpE  36.76 
 
 
173 aa  87  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000331967  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1605  GrpE protein  33.99 
 
 
162 aa  85.9  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0303276  normal  0.370472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0023  heat shock protein GrpE  30.49 
 
 
225 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  37.14 
 
 
175 aa  85.9  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0528  co-chaperone GrpE  31.55 
 
 
193 aa  85.5  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  33.74 
 
 
210 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  37.16 
 
 
176 aa  85.1  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1194  GrpE protein  35.88 
 
 
201 aa  85.1  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.422814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6948  GrpE protein  32.42 
 
 
217 aa  85.5  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  31.65 
 
 
224 aa  84.7  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0113  GrpE protein  32.21 
 
 
299 aa  85.1  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0210  heat shock protein GrpE  30.81 
 
 
199 aa  84.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000213319  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  32.12 
 
 
174 aa  84.7  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0427  GrpE protein  36.62 
 
 
191 aa  84.3  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0102412 
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  28.9 
 
 
190 aa  84  9e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  29.7 
 
 
190 aa  84  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2292  GrpE protein  31.48 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0174464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2666  co-chaperone GrpE  31.48 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.832748  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  32.48 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0077  GrpE protein  34.84 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000749846  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  33.14 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>