More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0101 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0101  GrpE protein  100 
 
 
186 aa  376  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.552759  normal  0.112338 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  36.55 
 
 
179 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  32.91 
 
 
213 aa  97.1  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6904  GrpE protein  33.55 
 
 
185 aa  94.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150675  normal  0.298497 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3208  GrpE protein  30 
 
 
204 aa  93.2  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.718226  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2080  heat shock protein GrpE  34.85 
 
 
195 aa  89.4  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0674  grpE protein  37.5 
 
 
190 aa  89  4e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.04297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  31.9 
 
 
190 aa  88.6  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1775  grpE protein  33.13 
 
 
194 aa  87.8  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1520  GrpE protein  33.82 
 
 
206 aa  87.8  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0812159  normal  0.974035 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1347  GrpE protein  34.72 
 
 
150 aa  87  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.966336  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3243  GrpE protein  30.34 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.10231  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5051  GrpE protein  35.77 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.845613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4694  GrpE protein  34.03 
 
 
246 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.958337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1599  heat shock protein GrpE  32.35 
 
 
171 aa  84.3  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.388628  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  29.66 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  30.63 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0016  heat shock protein GrpE  30.86 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0584  GrpE protein  30.5 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1323  GrpE protein  31.16 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2072  heat shock protein GrpE  32.37 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00151  heat shock protein GrpE  29.25 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  29.17 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2126  GrpE protein  30.34 
 
 
200 aa  82  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00151  heat shock protein GrpE  29.53 
 
 
239 aa  82  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.00526535  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2350  GrpE protein  30.77 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  29.66 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0491  GrpE protein  33.55 
 
 
261 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0506  GrpE protein  33.55 
 
 
261 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  30.22 
 
 
198 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00161  heat shock protein GrpE  30.67 
 
 
247 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0174287 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1182  GrpE protein  31.65 
 
 
221 aa  79  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0103986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08251  GrpE protein (Hsp-70 cofactor)  32.12 
 
 
191 aa  79  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.643992  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  32.7 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1423  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)-like  29.94 
 
 
215 aa  79  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0853  GrpE protein  34.39 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000644749  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1583  GrpE protein  31.21 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.852741  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01184  heat shock protein GrpE  31.58 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.200342  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  29.33 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  32.05 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00151  heat shock protein GrpE  30.52 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.948871 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  26.97 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0978  hypothetical protein  31.51 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.115351 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1442  heat shock protein GrpE  26.97 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.105191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  30.72 
 
 
231 aa  77  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00201  heat shock protein GrpE  28.49 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0732  GrpE protein  30.66 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.149267  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1873  GrpE protein  30.38 
 
 
207 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000365995  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  26.76 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2008  heat shock protein GrpE  27.81 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1343  heat shock protein GrpE  30.52 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0002  GrpE protein  35.14 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.531723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  31.34 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0377  heat shock protein GrpE  30.94 
 
 
248 aa  75.9  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4181  GrpE protein  33.58 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2551  GrpE protein  26.75 
 
 
260 aa  75.1  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1749  heat shock protein GrpE  31.69 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.935809  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  30.37 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  26.32 
 
 
191 aa  75.1  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  28.99 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2003  heat shock protein GrpE  27.15 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1669  GrpE protein  28.57 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  decreased coverage  0.00844873 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01170  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  26.11 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  30 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0944  hypothetical protein  30.83 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.104305  normal  0.177983 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0019  heat shock protein GrpE  29.34 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1087  GrpE protein  27.1 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0763252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  29.17 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  26.35 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  28.57 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  28.28 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  30.19 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1692  GrpE protein  28.93 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.347105  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4329  GrpE protein  28.57 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.134987  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_24940  chloroplast GrpE-like protein  31.65 
 
 
274 aa  72.4  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.167019  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  26.06 
 
 
186 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  25.87 
 
 
189 aa  72  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1552  GrpE protein  30.83 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.004309  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2695  GrpE protein  28.87 
 
 
202 aa  72  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.620591 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1206  GrpE protein  29.41 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.390676  hitchhiker  0.00686163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1997  GrpE protein  31.85 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.244965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  27.41 
 
 
244 aa  71.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1456  heat shock protein GrpE  29.1 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.022256  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0016  GrpE protein  28.93 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0339785  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1513  heat shock protein GrpE  29.1 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  29.61 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1488  GrpE protein  29.22 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4475  GrpE protein  28.26 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323495  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  25.87 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1400  co-chaperone protein GrpE  28.06 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1209  GrpE protein  27.95 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.177941  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1749  GrpE protein  30.15 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2004  GrpE protein  29.41 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154374  normal  0.256466 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1182  molecular chaperone  27.34 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00339423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  31.85 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  30.22 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0032  heat shock protein GrpE  29.61 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4391  GrpE protein  28.68 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.322098  normal  0.302959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  26.09 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0719  heat shock protein GrpE  27.21 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76077  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>