More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1724 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1724  ROK family protein  100 
 
 		 405 aa  805    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.77 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  23.63 
 
 		 405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.71 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  26.87 
 
 		 396 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  23.78 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  22.52 
 
 		 408 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.25 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  22.11 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  23.04 
 
 		 417 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  21.9 
 
 		 405 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  23.71 
 
 		 389 aa  109  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  23.34 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.26 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  22.19 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  20.27 
 
 		 410 aa  107  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  22.19 
 
 		 404 aa  106  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0714  xylose operon regulatory protein  25.07 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  27.65 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  22.83 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  26.58 
 
 		 320 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  21.88 
 
 		 435 aa  104  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  23.19 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  22.89 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  21.39 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  22.26 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  21.17 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  22.87 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  23.16 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  23.48 
 
 		 385 aa  100  6e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  23.2 
 
 		 372 aa  100  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  22.69 
 
 		 395 aa  99.8  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  23.23 
 
 		 406 aa  99.8  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  23.23 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  23.23 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  22.51 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  23.23 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  23.23 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  23.23 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  22.92 
 
 		 407 aa  99  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  20.92 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  20.6 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  23.89 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  23.89 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  24.51 
 
 		 442 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  23.89 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  23.89 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  23.89 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  23.89 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  23.89 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  23.89 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  23.89 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  21.79 
 
 		 409 aa  97.4  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  21.39 
 
 		 403 aa  97.1  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  22.32 
 
 		 406 aa  97.1  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  20.17 
 
 		 387 aa  96.3  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  21.33 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  21.95 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  23.36 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  23.48 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  22.07 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  26.3 
 
 		 378 aa  94.4  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  22.73 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  20.92 
 
 		 414 aa  94  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  21.78 
 
 		 408 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  20 
 
 		 400 aa  93.6  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  26.05 
 
 		 388 aa  93.2  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.62 
 
 		 312 aa  93.2  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0208  NagC family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 374 aa  92.8  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  22.19 
 
 		 406 aa  92.8  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  21.78 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  20.47 
 
 		 428 aa  92.8  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  19.8 
 
 		 395 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  21.78 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  24.91 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0253  ROK  21.6 
 
 		 466 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  28.09 
 
 		 396 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  18.97 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  20.96 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  20.06 
 
 		 425 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  20.06 
 
 		 425 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  22 
 
 		 397 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  19.19 
 
 		 389 aa  90.5  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  26.6 
 
 		 378 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  19.89 
 
 		 390 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  21.74 
 
 		 410 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  19.55 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  20.69 
 
 		 406 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  22.51 
 
 		 408 aa  90.1  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  20.69 
 
 		 406 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  20.69 
 
 		 406 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  23.6 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  20.68 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  19.66 
 
 		 425 aa  89  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  20.69 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  20.69 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  21.35 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  20.69 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  20.21 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>