More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0449 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0449  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
198 aa  393  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00280297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  32.67 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  31.25 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1748  hypothetical protein  30.67 
 
 
310 aa  63.5  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  32.84 
 
 
222 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  27.41 
 
 
203 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  26.67 
 
 
381 aa  62  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  27.27 
 
 
706 aa  60.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  27.22 
 
 
343 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  25.19 
 
 
367 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  25.19 
 
 
367 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  25.34 
 
 
319 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  27.22 
 
 
343 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  27.75 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  27.68 
 
 
515 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.34 
 
 
525 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  23.49 
 
 
355 aa  59.3  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0058  pentapeptide repeat-containing protein  34.45 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108417  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  29.45 
 
 
449 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0204  pentapeptide repeat protein  26.72 
 
 
358 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  26.67 
 
 
734 aa  58.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  26.92 
 
 
349 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  30.6 
 
 
268 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  27.94 
 
 
182 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  29.71 
 
 
204 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  26.35 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4879  pentapeptide repeat-containing protein  28.75 
 
 
657 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.511853 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  28.07 
 
 
844 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  32.17 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0864  heat shock protein DnaJ-like  31.78 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0957797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 
456 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  24.34 
 
 
227 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0869  pentapeptide repeat protein  32.73 
 
 
290 aa  55.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236368  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30.33 
 
 
493 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  25.61 
 
 
370 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  27.62 
 
 
489 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  30.33 
 
 
225 aa  55.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 
949 aa  55.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  31.97 
 
 
267 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0523  pentapeptide repeat protein  25.69 
 
 
115 aa  55.5  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.567805  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  25.99 
 
 
493 aa  55.1  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13397  hypothetical protein  22.75 
 
 
183 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.43127  normal  0.102743 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  29.77 
 
 
521 aa  55.1  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  20.61 
 
 
416 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  26.57 
 
 
309 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0997  pentapeptide repeat protein  28.37 
 
 
237 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  23.53 
 
 
360 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  25 
 
 
309 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1294  serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 
522 aa  53.9  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  22.88 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1636  Ion transport 2 domain protein  30.5 
 
 
366 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  22.88 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  23.95 
 
 
452 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  22.88 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  23.49 
 
 
386 aa  53.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  23.53 
 
 
360 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  27.54 
 
 
576 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  27.48 
 
 
886 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  24.79 
 
 
245 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0229  pentapeptide repeat protein  33.98 
 
 
162 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.584528 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  29.25 
 
 
448 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  25 
 
 
260 aa  53.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  26.86 
 
 
446 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  24.22 
 
 
186 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  22.88 
 
 
360 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  24.42 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  23.53 
 
 
360 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  25.2 
 
 
442 aa  53.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  30 
 
 
243 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  26.95 
 
 
441 aa  53.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  27.67 
 
 
350 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  24.67 
 
 
183 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  22.88 
 
 
360 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  22.88 
 
 
360 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  30.17 
 
 
245 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2272  pentapeptide repeat-containing protein  29.35 
 
 
681 aa  52.8  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  27.59 
 
 
234 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1857  pentapeptide repeat-containing protein  26.75 
 
 
241 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.899807  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  27.59 
 
 
234 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  32.2 
 
 
365 aa  52  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  29.61 
 
 
175 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  23.56 
 
 
242 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  26.81 
 
 
420 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  26.67 
 
 
333 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  27.95 
 
 
241 aa  52  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  26.36 
 
 
381 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  23.39 
 
 
453 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  29.91 
 
 
311 aa  51.6  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  30.83 
 
 
348 aa  51.6  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  29.77 
 
 
401 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  25.31 
 
 
199 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  29.77 
 
 
452 aa  51.6  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  28.19 
 
 
433 aa  51.6  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1751  pentapeptide repeat-containing protein  24.71 
 
 
212 aa  51.6  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861009  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  29.77 
 
 
401 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4759  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.84 
 
 
222 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  20.97 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  22.4 
 
 
485 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0521  hypothetical protein  26.83 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  30.83 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>