More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1163 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1163  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0217  porphobilinogen deaminase  54.95 
 
 		 290 aa  318  9e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000356603  normal  0.0285906 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0050  porphobilinogen deaminase  38.91 
 
 		 301 aa  195  7e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0968  porphobilinogen deaminase  38.38 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  hitchhiker  0.00994772 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1121  porphobilinogen deaminase  38.52 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.878665 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2245  porphobilinogen deaminase  39.3 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.53648  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1707  porphobilinogen deaminase  36.04 
 
 		 296 aa  182  7e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0124397 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1198  porphobilinogen deaminase  37.72 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0491  porphobilinogen deaminase  36.58 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1226  porphobilinogen deaminase  38.06 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000455197  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  38.43 
 
 		 310 aa  177  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1465  porphobilinogen deaminase  40.42 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0120  porphobilinogen deaminase  39.43 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.375076 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0048  porphobilinogen deaminase  39.26 
 
 		 304 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0680  porphobilinogen deaminase  39.09 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1324  porphobilinogen deaminase  39.68 
 
 		 342 aa  169  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  35.56 
 
 		 303 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  38.66 
 
 		 306 aa  168  9e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  35.44 
 
 		 303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1342  porphobilinogen deaminase  33.22 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1783  porphobilinogen deaminase  38.27 
 
 		 304 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3450  porphobilinogen deaminase  37.98 
 
 		 526 aa  165  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.78794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0983  porphobilinogen deaminase  39.34 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  37.37 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  35.35 
 
 		 310 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  35.66 
 
 		 285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  36.9 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1725  porphobilinogen deaminase  37.04 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  34.78 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  35.14 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  35.35 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  35.69 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  35.69 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  35.69 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  35.12 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  35.12 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  35.12 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  35.69 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  35.64 
 
 		 326 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04951  porphobilinogen deaminase  35.74 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.334606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  34.9 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  35.21 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  34.72 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  32.17 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  36.94 
 
 		 315 aa  156  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  36.01 
 
 		 309 aa  155  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1702  porphobilinogen deaminase  35.56 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  36.98 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1234  porphobilinogen deaminase  38.31 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  33.22 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  32.44 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  32.77 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  31.76 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  34.7 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  33.78 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  37.04 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2559  porphobilinogen deaminase  35 
 
 		 295 aa  152  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  35.29 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  35.12 
 
 		 320 aa  152  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2898  porphobilinogen deaminase  33.21 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101786  normal  0.0803505 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3300  porphobilinogen deaminase  33.21 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  32.32 
 
 		 319 aa  152  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  34.46 
 
 		 318 aa  152  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  35 
 
 		 309 aa  152  8.999999999999999e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  34.33 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  34.45 
 
 		 322 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  34.11 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  33.56 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2527  porphobilinogen deaminase  36.9 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.464027  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  36.07 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2890  porphobilinogen deaminase  30.79 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  35.16 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2377  porphobilinogen deaminase  30.79 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6800  porphobilinogen deaminase  33.55 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  33.56 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0526  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  37.25 
 
 		 542 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.654893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  33.56 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  33.11 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  31.31 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  33.11 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  33.56 
 
 		 317 aa  149  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  33.78 
 
 		 336 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  31.31 
 
 		 313 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  33.33 
 
 		 314 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  35.25 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3090  porphobilinogen deaminase  31.23 
 
 		 331 aa  149  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  33.78 
 
 		 318 aa  149  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  31.33 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  34.59 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07271  porphobilinogen deaminase  36.53 
 
 		 317 aa  148  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1680  porphobilinogen deaminase  36.08 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  36.59 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  33.96 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2232  porphobilinogen deaminase  31.7 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495959  normal  0.0113482 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  33.67 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  34.27 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  33.45 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  31.31 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  33.68 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  31.72 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>