More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1342 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1342  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 300 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  43.24 
 
 		 306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  39.34 
 
 		 313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  42.28 
 
 		 309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  40.13 
 
 		 313 aa  229  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  40.13 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  39.33 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  38.46 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  40.2 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  38.26 
 
 		 310 aa  224  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  38.64 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  39.61 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  38.98 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  41.64 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  38.46 
 
 		 313 aa  219  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  41.53 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  38.93 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  37.2 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  37.41 
 
 		 351 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  38.18 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  41.3 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0767  porphobilinogen deaminase  36.67 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  36.72 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  40.54 
 
 		 313 aa  209  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  37.87 
 
 		 300 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  37.87 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  36.58 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  38.18 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  42.07 
 
 		 310 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  35.59 
 
 		 312 aa  205  6e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 309 aa  205  7e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  37.54 
 
 		 320 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  37.54 
 
 		 320 aa  205  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  37.87 
 
 		 313 aa  205  9e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  35.25 
 
 		 314 aa  205  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  37.54 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  37.54 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  37.54 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  40.64 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  37.71 
 
 		 318 aa  203  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  37.63 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  37.33 
 
 		 318 aa  202  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  37.71 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  37.71 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  37.71 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  37.71 
 
 		 318 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  37.71 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  37.71 
 
 		 313 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  37.33 
 
 		 318 aa  202  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  37.71 
 
 		 313 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  36.9 
 
 		 322 aa  202  6e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1732  porphobilinogen deaminase  39.25 
 
 		 318 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0335479  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  37.71 
 
 		 320 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  37.84 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  38.44 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1437  porphobilinogen deaminase  37.02 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  38.05 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  36.88 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  37.37 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  37.97 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  34.78 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  38.15 
 
 		 320 aa  199  6e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0767  porphobilinogen deaminase  34.46 
 
 		 308 aa  199  6e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  38.26 
 
 		 285 aa  198  7.999999999999999e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  35.71 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  34.45 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1838  porphobilinogen deaminase  41.89 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  35.14 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0525  porphobilinogen deaminase  36.95 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  37.04 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  33.89 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  34.8 
 
 		 309 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  37.17 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1225  porphobilinogen deaminase  37.25 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0492  hydroxymethylbilane synthase  39.46 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  36.72 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  37.04 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  35.47 
 
 		 317 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1048  porphobilinogen deaminase  34 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0191591  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  34.68 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0406  porphobilinogen deaminase  38.23 
 
 		 311 aa  195  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  34.46 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2492  porphobilinogen deaminase  37.07 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39329  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  34.8 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1363  porphobilinogen deaminase  37.07 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1460  porphobilinogen deaminase  37.07 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  36.27 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  36.61 
 
 		 319 aa  192  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  39.01 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  36.95 
 
 		 313 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3276  porphobilinogen deaminase  37.71 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.541396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  33.65 
 
 		 339 aa  192  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  36.39 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  34 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  35.23 
 
 		 311 aa  192  6e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  38.01 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  33.89 
 
 		 308 aa  191  9e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  35.84 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  38.01 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  35.47 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>