More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0968 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0968  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 296 aa  585  1e-166  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  hitchhiker  0.00994772 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0050  porphobilinogen deaminase  80.41 
 
 		 301 aa  489  1e-137  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2245  porphobilinogen deaminase  72.73 
 
 		 297 aa  424  1e-117  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.53648  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1707  porphobilinogen deaminase  72.73 
 
 		 296 aa  417  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0124397 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1121  porphobilinogen deaminase  50.69 
 
 		 305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.878665 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0491  porphobilinogen deaminase  40.96 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0217  porphobilinogen deaminase  42.71 
 
 		 290 aa  206  6e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000356603  normal  0.0285906 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  42.28 
 
 		 309 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  42.28 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1163  porphobilinogen deaminase  38.38 
 
 		 293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  41.95 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  41.95 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  41.95 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  41.95 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  41.95 
 
 		 309 aa  199  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  41.95 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  41.95 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  48.39 
 
 		 303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  41.61 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  40.52 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  44.76 
 
 		 310 aa  195  9e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  39.72 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  41.55 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1762  porphobilinogen deaminase  38.75 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1728  porphobilinogen deaminase  38.75 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  40.27 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  47.97 
 
 		 303 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  40.27 
 
 		 309 aa  192  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  44.88 
 
 		 316 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  43.22 
 
 		 300 aa  189  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1234  porphobilinogen deaminase  37.71 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0387484  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  42.45 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  42.51 
 
 		 314 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  42.91 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  38.83 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  42.21 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  43.43 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  38.04 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  41.92 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  44.53 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1374  porphobilinogen deaminase  42 
 
 		 308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212718  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  44.13 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0098  porphobilinogen deaminase  42.51 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  44.98 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  43.24 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  41.46 
 
 		 310 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1225  porphobilinogen deaminase  41.64 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  43.32 
 
 		 317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  42.91 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1342  porphobilinogen deaminase  40.08 
 
 		 300 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  42.86 
 
 		 320 aa  182  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0318  porphobilinogen deaminase  42.17 
 
 		 299 aa  182  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  43.72 
 
 		 310 aa  182  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1258  porphobilinogen deaminase  41.64 
 
 		 305 aa  182  8.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  43.72 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  41.83 
 
 		 313 aa  182  9.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0089  hydroxymethylbilane synthase  42.51 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  43.55 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  41.7 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  43.15 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  42.51 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  41.94 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  43.32 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  43.72 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  43.65 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  43.55 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  40.61 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  43.55 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  39.12 
 
 		 336 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  41.75 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0048  porphobilinogen deaminase  38.25 
 
 		 304 aa  178  9e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  43.44 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3530  porphobilinogen deaminase  40.48 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  43.15 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  43.55 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  37.63 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  38.75 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2704  porphobilinogen deaminase  38.44 
 
 		 347 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  38.57 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  43.15 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  42.11 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  41.94 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  36.91 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  43.15 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  43.15 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  43.15 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  36.24 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  42.74 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  43.15 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  40.49 
 
 		 320 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  36.73 
 
 		 316 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  43.72 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  43.72 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  42.86 
 
 		 316 aa  176  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  40.45 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1277  porphobilinogen deaminase  36.49 
 
 		 293 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000211617  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  43.55 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1048  porphobilinogen deaminase  40.96 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0191591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  43.03 
 
 		 312 aa  175  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  43.32 
 
 		 317 aa  175  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>