More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0217 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0217  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000356603  normal  0.0285906 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1163  porphobilinogen deaminase  54.95 
 
 		 293 aa  318  9e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1121  porphobilinogen deaminase  43.2 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.878665 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0050  porphobilinogen deaminase  44.89 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1465  porphobilinogen deaminase  45.99 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0968  porphobilinogen deaminase  42.71 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  hitchhiker  0.00994772 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2245  porphobilinogen deaminase  42.86 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.53648  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1707  porphobilinogen deaminase  43.15 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0124397 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  40.4 
 
 		 303 aa  192  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0983  porphobilinogen deaminase  43.8 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188272  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0048  porphobilinogen deaminase  41.8 
 
 		 304 aa  185  7e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0318  porphobilinogen deaminase  43.92 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  37.79 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  39.12 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1226  porphobilinogen deaminase  41.87 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000455197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  39.39 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  37.28 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  44 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0680  porphobilinogen deaminase  39.61 
 
 		 304 aa  178  9e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1198  porphobilinogen deaminase  39.39 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0526  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  39.29 
 
 		 542 aa  175  8e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.654893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1374  porphobilinogen deaminase  39.92 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212718  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0120  porphobilinogen deaminase  38.43 
 
 		 304 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.375076 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1324  porphobilinogen deaminase  38.43 
 
 		 342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1783  porphobilinogen deaminase  39.34 
 
 		 304 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370283  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  37.59 
 
 		 312 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1725  porphobilinogen deaminase  42.8 
 
 		 294 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  38.51 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  42.8 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  42 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  39.12 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  41.27 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1234  porphobilinogen deaminase  37.1 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  42.86 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  41.11 
 
 		 322 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  41.27 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  42.29 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  38.75 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  38.14 
 
 		 312 aa  169  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  39.46 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2559  porphobilinogen deaminase  38.84 
 
 		 295 aa  168  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  37.84 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0767  porphobilinogen deaminase  37.07 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  41.9 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1999  porphobilinogen deaminase  36.49 
 
 		 318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  decreased coverage  0.0000671123 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0691  porphobilinogen deaminase  38.8 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.411778  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0491  porphobilinogen deaminase  41.53 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0118  porphobilinogen deaminase  39.02 
 
 		 318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  37.5 
 
 		 313 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  37.5 
 
 		 313 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  41.27 
 
 		 313 aa  165  9e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  37.8 
 
 		 308 aa  165  9e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  37.46 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  41.11 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  42.21 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  39.47 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  42.62 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  42.62 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  42.21 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  42.62 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  42.62 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  36.79 
 
 		 317 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  40.32 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  42.62 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  42.21 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  42.21 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  42.21 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2890  porphobilinogen deaminase  37.31 
 
 		 320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2377  porphobilinogen deaminase  37.31 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  37.67 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0767  porphobilinogen deaminase  38.82 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  35.45 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  36.86 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1225  porphobilinogen deaminase  36.49 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  37.04 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1715  porphobilinogen deaminase  37.6 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2232  porphobilinogen deaminase  39.67 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495959  normal  0.0113482 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  41.11 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  38.51 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  38.51 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  47.76 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  38.23 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  37.46 
 
 		 326 aa  159  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3090  porphobilinogen deaminase  36 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3674  porphobilinogen deaminase  38.6 
 
 		 311 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1258  porphobilinogen deaminase  36.15 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  39.47 
 
 		 324 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1437  porphobilinogen deaminase  36.03 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1048  porphobilinogen deaminase  35.15 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0191591  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  39.29 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  41.32 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1125  porphobilinogen deaminase  43.12 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0176422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  36.03 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1040  porphobilinogen deaminase  36.24 
 
 		 345 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.866098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  36.7 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3530  porphobilinogen deaminase  36.3 
 
 		 303 aa  158  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6800  porphobilinogen deaminase  36.33 
 
 		 320 aa  158  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  38.18 
 
 		 318 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3664  porphobilinogen deaminase  38.68 
 
 		 334 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  38.18 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>