More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2245 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2245  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 297 aa  585  1e-166  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.53648  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0050  porphobilinogen deaminase  72.76 
 
 		 301 aa  443  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1707  porphobilinogen deaminase  71.62 
 
 		 296 aa  425  1e-118  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0124397 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0968  porphobilinogen deaminase  72.73 
 
 		 296 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  hitchhiker  0.00994772 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1121  porphobilinogen deaminase  49.15 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.878665 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0491  porphobilinogen deaminase  42.09 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  40.97 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  40.21 
 
 		 303 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  41.49 
 
 		 311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1234  porphobilinogen deaminase  36.86 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0387484  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0217  porphobilinogen deaminase  42.86 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000356603  normal  0.0285906 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  39.59 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  40.21 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  39.25 
 
 		 309 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1728  porphobilinogen deaminase  36.52 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  40.28 
 
 		 309 aa  193  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1762  porphobilinogen deaminase  36.52 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  39.52 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  39.59 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  39.59 
 
 		 309 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  39.59 
 
 		 309 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6800  porphobilinogen deaminase  39.2 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  39.59 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  39.59 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  39.25 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  39.45 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  38.62 
 
 		 311 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  43.87 
 
 		 317 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  39.87 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  37.41 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  37.8 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  36.58 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  38.8 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  38.7 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  41.73 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  39.78 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  42.35 
 
 		 316 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  39.53 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  39.16 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1163  porphobilinogen deaminase  39.3 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  42.51 
 
 		 314 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3530  porphobilinogen deaminase  39.79 
 
 		 303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  37.07 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1374  porphobilinogen deaminase  39.39 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212718  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1342  porphobilinogen deaminase  36.33 
 
 		 300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  42.91 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  41.24 
 
 		 304 aa  181  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  41.41 
 
 		 339 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  41.63 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1702  porphobilinogen deaminase  37.87 
 
 		 305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  41.34 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  38.08 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0098  porphobilinogen deaminase  41.27 
 
 		 345 aa  179  7e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  35.74 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  37.37 
 
 		 309 aa  178  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1225  porphobilinogen deaminase  42.51 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3674  porphobilinogen deaminase  40.48 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  39.68 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1258  porphobilinogen deaminase  42.11 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3202  porphobilinogen deaminase  35.15 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0318  porphobilinogen deaminase  40.16 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  41.41 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  37.2 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  37.95 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  41.41 
 
 		 315 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  36.75 
 
 		 324 aa  175  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1324  porphobilinogen deaminase  38.28 
 
 		 342 aa  175  9e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0048  porphobilinogen deaminase  40.08 
 
 		 304 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  37.04 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  36.05 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  40.23 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0089  hydroxymethylbilane synthase  40.08 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  36.07 
 
 		 316 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2232  porphobilinogen deaminase  38.85 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495959  normal  0.0113482 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  36.12 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2890  porphobilinogen deaminase  37.86 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  39.25 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2377  porphobilinogen deaminase  37.86 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  34.56 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  36.58 
 
 		 316 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  36.36 
 
 		 326 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  37.33 
 
 		 306 aa  172  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  36.39 
 
 		 314 aa  172  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  36.91 
 
 		 316 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2966  porphobilinogen deaminase  36.3 
 
 		 330 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  37.63 
 
 		 311 aa  172  7.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  36.9 
 
 		 313 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  37.67 
 
 		 285 aa  172  9e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3699  porphobilinogen deaminase  35.27 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1385  porphobilinogen deaminase  41.06 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  37.07 
 
 		 336 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1437  porphobilinogen deaminase  39.29 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0680  porphobilinogen deaminase  40.7 
 
 		 304 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  37.54 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0649  porphobilinogen deaminase  41.06 
 
 		 307 aa  169  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.485602  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  35.33 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0570  porphobilinogen deaminase  41.06 
 
 		 307 aa  169  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1422  porphobilinogen deaminase  37.11 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.168494  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1783  porphobilinogen deaminase  40.47 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370283  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  40.07 
 
 		 322 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>