More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1707 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1707  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 296 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0124397 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0050  porphobilinogen deaminase  75.59 
 
 		 301 aa  460  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2245  porphobilinogen deaminase  71.62 
 
 		 297 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.53648  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0968  porphobilinogen deaminase  72.73 
 
 		 296 aa  413  1e-114  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  hitchhiker  0.00994772 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1121  porphobilinogen deaminase  50.17 
 
 		 305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.878665 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0217  porphobilinogen deaminase  43.15 
 
 		 290 aa  205  8e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000356603  normal  0.0285906 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0491  porphobilinogen deaminase  37.97 
 
 		 311 aa  200  3e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  44.22 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  42.02 
 
 		 300 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  41.49 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  39.14 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  43.55 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  38.72 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  38.72 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  39.06 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  39.06 
 
 		 309 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1342  porphobilinogen deaminase  38.83 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  39.06 
 
 		 309 aa  188  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  39.06 
 
 		 309 aa  188  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  39.06 
 
 		 309 aa  188  9e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  39.06 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  39.06 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  39.06 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1163  porphobilinogen deaminase  36.04 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  38.38 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  40.38 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  39.85 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  36.79 
 
 		 310 aa  185  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  38.35 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  37.37 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6800  porphobilinogen deaminase  39.67 
 
 		 320 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1728  porphobilinogen deaminase  33.79 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1762  porphobilinogen deaminase  33.79 
 
 		 308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  42.27 
 
 		 304 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3674  porphobilinogen deaminase  39.12 
 
 		 311 aa  181  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  40.46 
 
 		 309 aa  181  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  43.78 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  39.58 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3530  porphobilinogen deaminase  41.3 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  43.95 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  39.87 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  40.65 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  37.73 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1234  porphobilinogen deaminase  33.45 
 
 		 308 aa  178  9e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0387484  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  36.64 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0354  porphobilinogen deaminase  35.19 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  38.69 
 
 		 308 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  43.09 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  43.51 
 
 		 309 aa  175  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0318  porphobilinogen deaminase  38.4 
 
 		 299 aa  175  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  40.49 
 
 		 314 aa  175  9e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  36.68 
 
 		 314 aa  175  9e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  41.94 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  40.08 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  39 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  38.83 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1385  porphobilinogen deaminase  38.87 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  38.28 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0048  porphobilinogen deaminase  37.4 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  38.83 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1783  porphobilinogen deaminase  37.8 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370283  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0496  porphobilinogen deaminase  35.57 
 
 		 316 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1225  porphobilinogen deaminase  40.82 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0098  porphobilinogen deaminase  38.06 
 
 		 345 aa  172  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  42 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0767  porphobilinogen deaminase  38.58 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1022  porphobilinogen deaminase  34.92 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05221  porphobilinogen deaminase  35.45 
 
 		 316 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0649  porphobilinogen deaminase  38.21 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.485602  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2568  porphobilinogen deaminase  38.7 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0824843 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0570  porphobilinogen deaminase  38.21 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  40.98 
 
 		 312 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  39.25 
 
 		 309 aa  172  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  39.84 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05521  porphobilinogen deaminase  35.12 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.132832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  37.98 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  38.36 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1324  porphobilinogen deaminase  37.31 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  40.89 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  40.87 
 
 		 320 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  40.16 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  35.71 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2966  porphobilinogen deaminase  36.39 
 
 		 330 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0701  porphobilinogen deaminase  35.43 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.141584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  40.87 
 
 		 318 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  41.04 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  41.27 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  40.87 
 
 		 320 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  35.47 
 
 		 320 aa  170  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  40.87 
 
 		 320 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  40.87 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  40.87 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  40.65 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  40.87 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3699  porphobilinogen deaminase  35.71 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05591  porphobilinogen deaminase  34.97 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  36.63 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  36.4 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1258  porphobilinogen deaminase  40.45 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3202  porphobilinogen deaminase  41.18 
 
 		 318 aa  169  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0969809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>