More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1725 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1725  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 294 aa  585  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0983  porphobilinogen deaminase  68.35 
 
 		 294 aa  388  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188272  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1234  porphobilinogen deaminase  61.09 
 
 		 294 aa  364  1e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2559  porphobilinogen deaminase  52.22 
 
 		 295 aa  300  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0526  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  53.74 
 
 		 542 aa  290  1e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.654893 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1226  porphobilinogen deaminase  48.83 
 
 		 309 aa  250  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000455197  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1465  porphobilinogen deaminase  46.69 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  42.2 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1125  porphobilinogen deaminase  46.82 
 
 		 270 aa  199  5e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0176422  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0048  porphobilinogen deaminase  41.39 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  37.23 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  39.4 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2984  porphobilinogen deaminase  39.86 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.896426 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2898  porphobilinogen deaminase  40.58 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101786  normal  0.0803505 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3300  porphobilinogen deaminase  40.58 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  43.27 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2660  porphobilinogen deaminase  40.6 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  44.08 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1398  porphobilinogen deaminase  39.93 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2791  porphobilinogen deaminase  40.23 
 
 		 309 aa  173  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  42.49 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  42.7 
 
 		 320 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  38.44 
 
 		 322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  36.88 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1342  porphobilinogen deaminase  38.85 
 
 		 300 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  40.77 
 
 		 312 aa  172  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  42.25 
 
 		 307 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  42.62 
 
 		 313 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0217  porphobilinogen deaminase  42.8 
 
 		 290 aa  172  5.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000356603  normal  0.0285906 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  40.41 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  42.21 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  39.46 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  38.64 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  39.8 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  41.07 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  38.64 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3450  porphobilinogen deaminase  36.69 
 
 		 526 aa  169  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.78794 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  39.36 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  41.8 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  40.45 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  40.45 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  40.45 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0680  porphobilinogen deaminase  37.07 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1454  porphobilinogen deaminase  40.08 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.179158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  38.33 
 
 		 309 aa  168  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  39.22 
 
 		 312 aa  168  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  40.45 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  40.45 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  37.33 
 
 		 313 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  40.45 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  38.59 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  42.11 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  40.07 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  40.57 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  37.32 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  42.11 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  44.76 
 
 		 304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  40.45 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  38.7 
 
 		 336 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  38.51 
 
 		 320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  37.12 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  40.82 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  37.05 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  42.47 
 
 		 358 aa  166  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6500  porphobilinogen deaminase  37.23 
 
 		 307 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  40.82 
 
 		 312 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0549  Hydroxymethylbilane synthase  41.47 
 
 		 306 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  0.484278 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1783  porphobilinogen deaminase  39.18 
 
 		 304 aa  165  8e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370283  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  40.41 
 
 		 317 aa  165  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  40.37 
 
 		 318 aa  165  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  40.37 
 
 		 320 aa  165  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  40.37 
 
 		 320 aa  165  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  40.37 
 
 		 320 aa  165  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  34.74 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  38.08 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  36.25 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  38.23 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  38.74 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  40.37 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  38.16 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  40.37 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5394  porphobilinogen deaminase  38.72 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  38.21 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  39.53 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  39.63 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3002  hydroxymethylbilane synthase  40.62 
 
 		 317 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00423817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  38.16 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  41.24 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  40.73 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1258  porphobilinogen deaminase  42.57 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  39.84 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1105  porphobilinogen deaminase  36.12 
 
 		 377 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.101851  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  37 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  38.87 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  40.07 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  42.11 
 
 		 308 aa  162  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  39.92 
 
 		 319 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>