More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0983 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0983  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 294 aa  584  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188272  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1725  porphobilinogen deaminase  68.35 
 
 		 294 aa  388  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1234  porphobilinogen deaminase  64.38 
 
 		 294 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2559  porphobilinogen deaminase  56.85 
 
 		 295 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0526  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  58.36 
 
 		 542 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.654893 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1465  porphobilinogen deaminase  49.65 
 
 		 316 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1226  porphobilinogen deaminase  47.96 
 
 		 309 aa  236  4e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000455197  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  42.7 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1125  porphobilinogen deaminase  48.52 
 
 		 270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0176422  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0217  porphobilinogen deaminase  43.8 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000356603  normal  0.0285906 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  43.62 
 
 		 285 aa  185  8e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3450  porphobilinogen deaminase  41.09 
 
 		 526 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.78794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  46.4 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  42.47 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  44.19 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  41.16 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3675  porphobilinogen deaminase  36.59 
 
 		 380 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  41.22 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  35.89 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  40.07 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  40.23 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2014  porphobilinogen deaminase  38.67 
 
 		 378 aa  179  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.898337  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0491  porphobilinogen deaminase  38.05 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6500  porphobilinogen deaminase  39.92 
 
 		 307 aa  178  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  46.72 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  42.59 
 
 		 310 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  41.16 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1454  porphobilinogen deaminase  37.64 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.179158  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1398  porphobilinogen deaminase  42.48 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  43.33 
 
 		 318 aa  175  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  41.7 
 
 		 318 aa  175  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  46.44 
 
 		 312 aa  175  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1342  porphobilinogen deaminase  39.86 
 
 		 300 aa  175  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  42.44 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  44.26 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  42.31 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  38.98 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  42.31 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  42.31 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  42.31 
 
 		 309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  41.67 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  42.31 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  42.31 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2660  porphobilinogen deaminase  41.73 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  41.92 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  43.75 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3002  hydroxymethylbilane synthase  42.75 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00423817  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2791  porphobilinogen deaminase  40.98 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  41.92 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  41.92 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  40.41 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0944  porphobilinogen deaminase  36.65 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700736  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  43.66 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  39.16 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  41.39 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  43.17 
 
 		 318 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  43.17 
 
 		 320 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  43.67 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  43.17 
 
 		 320 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  41.92 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  43.17 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  44.26 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  43.17 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  41.98 
 
 		 311 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  42.8 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2898  porphobilinogen deaminase  44.13 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101786  normal  0.0803505 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  42.8 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  42.8 
 
 		 320 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  42.07 
 
 		 309 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  42.8 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  42.8 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3300  porphobilinogen deaminase  44.13 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  42.8 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  42.8 
 
 		 318 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  42.8 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  42.8 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  40.58 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  38.8 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2007  porphobilinogen deaminase  39.27 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1838  porphobilinogen deaminase  43.9 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2032  porphobilinogen deaminase  38.61 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  40.34 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0048  porphobilinogen deaminase  39.34 
 
 		 304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0495  porphobilinogen deaminase  46.12 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1324  porphobilinogen deaminase  39.11 
 
 		 342 aa  166  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0354  porphobilinogen deaminase  40.98 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0318  porphobilinogen deaminase  39.68 
 
 		 299 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0701  porphobilinogen deaminase  40.16 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.141584  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  41.91 
 
 		 313 aa  165  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  40.08 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5487  porphobilinogen deaminase  43.44 
 
 		 313 aa  165  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  43.85 
 
 		 307 aa  165  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  42.56 
 
 		 309 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0525  porphobilinogen deaminase  42.04 
 
 		 311 aa  165  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1163  porphobilinogen deaminase  39.34 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  40.62 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  40.32 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0680  porphobilinogen deaminase  39.34 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  42.01 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  41.53 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>