More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2559 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2559  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 295 aa  597  1e-170  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1234  porphobilinogen deaminase  57.68 
 
 		 294 aa  339  2.9999999999999998e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0983  porphobilinogen deaminase  56.85 
 
 		 294 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188272  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1725  porphobilinogen deaminase  52.22 
 
 		 294 aa  300  1e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0526  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  47.95 
 
 		 542 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.654893 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1465  porphobilinogen deaminase  46.3 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1226  porphobilinogen deaminase  43.23 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000455197  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1125  porphobilinogen deaminase  46.79 
 
 		 270 aa  205  6e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0176422  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  37.63 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  40.13 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0048  porphobilinogen deaminase  40.41 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  41.7 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  41.46 
 
 		 285 aa  175  7e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  38.11 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0680  porphobilinogen deaminase  40.82 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1783  porphobilinogen deaminase  40.82 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370283  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  40.14 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0944  porphobilinogen deaminase  36.3 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700736  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  39.6 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  41.15 
 
 		 308 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1454  porphobilinogen deaminase  38.69 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.179158  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2791  porphobilinogen deaminase  40.23 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2014  porphobilinogen deaminase  36.7 
 
 		 378 aa  168  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.898337  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0217  porphobilinogen deaminase  38.84 
 
 		 290 aa  168  8e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000356603  normal  0.0285906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  37.59 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2660  porphobilinogen deaminase  39.1 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3675  porphobilinogen deaminase  36.7 
 
 		 380 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1398  porphobilinogen deaminase  38.75 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0120  porphobilinogen deaminase  40.82 
 
 		 304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.375076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  39.59 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  34.56 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  39.13 
 
 		 309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  36.04 
 
 		 310 aa  165  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3450  porphobilinogen deaminase  38 
 
 		 526 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.78794 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0495  porphobilinogen deaminase  41.53 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1324  porphobilinogen deaminase  38.1 
 
 		 342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  40.15 
 
 		 358 aa  163  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  39.93 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2984  porphobilinogen deaminase  36.94 
 
 		 304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.896426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  37.45 
 
 		 317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0967  porphobilinogen deaminase  37.13 
 
 		 320 aa  162  9e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.219304  normal  0.534039 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  36.07 
 
 		 309 aa  162  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0542  porphobilinogen deaminase  36.36 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0630058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0549  Hydroxymethylbilane synthase  39.1 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  0.484278 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  35.87 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03640  porphobilinogen deaminase  37.04 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  40.15 
 
 		 351 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02860  porphobilinogen deaminase  38.59 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.302767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6500  porphobilinogen deaminase  36.11 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0710  porphobilinogen deaminase  40.91 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  34.93 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  38.93 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0318  porphobilinogen deaminase  39.36 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  38.37 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  41.87 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  35.43 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  38.63 
 
 		 324 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  39.68 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  40.08 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  37.62 
 
 		 320 aa  158  8e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  37.62 
 
 		 320 aa  158  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  37.62 
 
 		 318 aa  159  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  38.89 
 
 		 313 aa  158  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  37.62 
 
 		 320 aa  158  8e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  38.54 
 
 		 313 aa  158  9e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0491  porphobilinogen deaminase  34.34 
 
 		 311 aa  158  9e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  38.54 
 
 		 313 aa  158  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3300  porphobilinogen deaminase  40.4 
 
 		 306 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.999911  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  38.46 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3674  porphobilinogen deaminase  40.33 
 
 		 311 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  37.62 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  40.32 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  33.67 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2898  porphobilinogen deaminase  40.4 
 
 		 306 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101786  normal  0.0803505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  39.23 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  37.62 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1014  porphobilinogen deaminase  40.41 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0827893  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  41.06 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  33.33 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  35.64 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  35.28 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  38.85 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  35.17 
 
 		 322 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  35.53 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  35.64 
 
 		 309 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  38.46 
 
 		 315 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  38.16 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  36.21 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  36.67 
 
 		 321 aa  155  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0118  porphobilinogen deaminase  35.57 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  39.43 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  39.92 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  38.46 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1121  porphobilinogen deaminase  35.11 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.878665 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  38.37 
 
 		 339 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  38.08 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  39.02 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  39.02 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  38.87 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  39.02 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>