More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1125 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1125  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 270 aa  533  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0176422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1226  porphobilinogen deaminase  56.93 
 
 		 309 aa  298  9e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000455197  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1465  porphobilinogen deaminase  53.73 
 
 		 316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2559  porphobilinogen deaminase  46.79 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0983  porphobilinogen deaminase  48.52 
 
 		 294 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188272  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1725  porphobilinogen deaminase  46.82 
 
 		 294 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0526  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  46.64 
 
 		 542 aa  199  5e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.654893 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1234  porphobilinogen deaminase  45.25 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3675  porphobilinogen deaminase  37.35 
 
 		 380 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2014  porphobilinogen deaminase  36.02 
 
 		 378 aa  190  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.898337  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  42.32 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  40.96 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0491  porphobilinogen deaminase  39.11 
 
 		 311 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1105  porphobilinogen deaminase  35.94 
 
 		 377 aa  186  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.101851  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  39.03 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  39.55 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  39.64 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  42.8 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  42.21 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1048  porphobilinogen deaminase  36.73 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0191591  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  39.93 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  41.39 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  41.45 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  41.39 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  41.39 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  41.76 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  41.18 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  35.61 
 
 		 311 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  41.24 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  36.94 
 
 		 314 aa  178  9e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  41.18 
 
 		 309 aa  178  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0525  porphobilinogen deaminase  39.25 
 
 		 311 aa  178  9e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  42.12 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  41.6 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  41.18 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  45.06 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  38.81 
 
 		 317 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  40.37 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  40.91 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  42.42 
 
 		 303 aa  175  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  38.87 
 
 		 310 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  36.74 
 
 		 308 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  41.39 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  43.4 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  37.97 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  37.92 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  40.23 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  41.13 
 
 		 313 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0217  porphobilinogen deaminase  43.12 
 
 		 290 aa  171  9e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000356603  normal  0.0285906 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  35.79 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  38.52 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0061  porphobilinogen deaminase  37.36 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3202  porphobilinogen deaminase  40.23 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  36.98 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  38.29 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0700  porphobilinogen deaminase  40.17 
 
 		 334 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  38.55 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0767  porphobilinogen deaminase  34.59 
 
 		 308 aa  169  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  39.71 
 
 		 313 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0691  porphobilinogen deaminase  35.56 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.411778  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  40.7 
 
 		 312 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2966  porphobilinogen deaminase  37.36 
 
 		 330 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0318  porphobilinogen deaminase  38.43 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  38.66 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  38.49 
 
 		 322 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  37.17 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  42.49 
 
 		 358 aa  169  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  38.53 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3674  porphobilinogen deaminase  40.76 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  37.41 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  39.92 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  38.52 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  37.74 
 
 		 312 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  33.83 
 
 		 313 aa  169  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  37.41 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  38.29 
 
 		 313 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  40.52 
 
 		 314 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  36.36 
 
 		 318 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  40.52 
 
 		 304 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  36.12 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6800  porphobilinogen deaminase  42.73 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  37.04 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1385  porphobilinogen deaminase  34.81 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  37.36 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  43.32 
 
 		 317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0767  porphobilinogen deaminase  36.76 
 
 		 311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  36.47 
 
 		 320 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  42.62 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  35.74 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  35.74 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  35.74 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  35.74 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  35.74 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  35.74 
 
 		 318 aa  166  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  38.74 
 
 		 314 aa  165  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  40.15 
 
 		 309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  40.15 
 
 		 309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0044  porphobilinogen deaminase  39.6 
 
 		 307 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0780784  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0649  porphobilinogen deaminase  34.46 
 
 		 307 aa  165  8e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.485602  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  35.74 
 
 		 320 aa  165  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>