More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1105 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1105  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 377 aa  738    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.101851  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2014  porphobilinogen deaminase  67.58 
 
 		 378 aa  493  9.999999999999999e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.898337  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3675  porphobilinogen deaminase  66.21 
 
 		 380 aa  485  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0927  porphobilinogen deaminase  60.87 
 
 		 373 aa  411  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0460194  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2252  porphobilinogen deaminase  55.35 
 
 		 385 aa  380  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.10668  normal  0.034816 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1226  porphobilinogen deaminase  37.95 
 
 		 309 aa  225  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000455197  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1465  porphobilinogen deaminase  36.16 
 
 		 316 aa  194  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  39.32 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  38.46 
 
 		 311 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  34.65 
 
 		 313 aa  187  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  36.89 
 
 		 312 aa  186  8e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  43.29 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  35.46 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  31.84 
 
 		 308 aa  183  5.0000000000000004e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1374  porphobilinogen deaminase  39.27 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212718  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  35.91 
 
 		 315 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  35.81 
 
 		 310 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1234  porphobilinogen deaminase  34.84 
 
 		 294 aa  177  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33164  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  36.36 
 
 		 318 aa  177  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  35.47 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2232  porphobilinogen deaminase  38.83 
 
 		 312 aa  176  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495959  normal  0.0113482 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2890  porphobilinogen deaminase  37.46 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  35.16 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  32.77 
 
 		 311 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  32.13 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1125  porphobilinogen deaminase  35.94 
 
 		 270 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0176422  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  34.17 
 
 		 312 aa  173  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  37.17 
 
 		 313 aa  173  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2377  porphobilinogen deaminase  37.14 
 
 		 310 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  36.54 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03640  porphobilinogen deaminase  33.15 
 
 		 305 aa  172  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26790  hydroxymethylbilane synthase  35.22 
 
 		 337 aa  171  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  33.8 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  35.43 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  34.54 
 
 		 326 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2660  porphobilinogen deaminase  33.84 
 
 		 309 aa  169  8e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0357  porphobilinogen deaminase  37.26 
 
 		 322 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  33.33 
 
 		 285 aa  168  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2791  porphobilinogen deaminase  33.54 
 
 		 309 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6800  porphobilinogen deaminase  34.08 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  34.07 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  35.69 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  34.79 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  34.9 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0691  porphobilinogen deaminase  34.53 
 
 		 303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.411778  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  36.6 
 
 		 316 aa  167  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  35.67 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3450  porphobilinogen deaminase  36.63 
 
 		 526 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.78794 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  36.6 
 
 		 315 aa  166  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  33.99 
 
 		 310 aa  166  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  35.44 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  34.05 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  32.6 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  35.74 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3090  porphobilinogen deaminase  38.38 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0427  porphobilinogen deaminase  37.53 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.751162  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  35.03 
 
 		 310 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  34.52 
 
 		 310 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0044  porphobilinogen deaminase  35.02 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0780784  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1715  porphobilinogen deaminase  36.25 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  35.53 
 
 		 309 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  35.53 
 
 		 309 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1725  porphobilinogen deaminase  36.12 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1048  porphobilinogen deaminase  31.74 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0191591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  34.95 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  35.53 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  36.75 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  36.75 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  36.75 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  36.75 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1978  porphobilinogen deaminase  40.33 
 
 		 305 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000417837  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  36.75 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  35.39 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  35.2 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4320  porphobilinogen deaminase  36.75 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.365174  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  35.39 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  35.2 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  35.2 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  36.75 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  35.53 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  36.75 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6729  porphobilinogen deaminase  36.49 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  34.43 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  33.33 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  36.1 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  36.89 
 
 		 310 aa  160  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  35.06 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0318  porphobilinogen deaminase  32.78 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  36.42 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  34.52 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  33.98 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  36.09 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0526  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  33.52 
 
 		 542 aa  159  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.654893 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  35.06 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0649  porphobilinogen deaminase  30.34 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.485602  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0570  porphobilinogen deaminase  30.34 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0983  porphobilinogen deaminase  36 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188272  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  34.3 
 
 		 310 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  35.53 
 
 		 313 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  33.6 
 
 		 331 aa  158  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>