More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2252 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2252  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 385 aa  743    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.10668  normal  0.034816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2014  porphobilinogen deaminase  61.54 
 
 		 378 aa  438  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.898337  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3675  porphobilinogen deaminase  61.97 
 
 		 380 aa  434  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1105  porphobilinogen deaminase  56.64 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.101851  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0927  porphobilinogen deaminase  57.98 
 
 		 373 aa  384  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0460194  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  54.84 
 
 		 312 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0767  porphobilinogen deaminase  28.73 
 
 		 308 aa  152  8e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1385  porphobilinogen deaminase  27.45 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3437  porphobilinogen deaminase  37.42 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000351099  decreased coverage  0.00118997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8325  porphobilinogen deaminase  50.62 
 
 		 317 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2489  porphobilinogen deaminase  34.94 
 
 		 332 aa  136  7.000000000000001e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100869 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  31.08 
 
 		 313 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  31.08 
 
 		 313 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  31.08 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  31.08 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  31.08 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  50.94 
 
 		 317 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  30.98 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1374  porphobilinogen deaminase  33.06 
 
 		 308 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212718  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  46.1 
 
 		 313 aa  133  5e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2767  porphobilinogen deaminase  34.09 
 
 		 332 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  48.37 
 
 		 311 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1040  porphobilinogen deaminase  49.68 
 
 		 345 aa  132  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.866098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0044  porphobilinogen deaminase  50 
 
 		 307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0780784  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0968  porphobilinogen deaminase  46.79 
 
 		 296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  hitchhiker  0.00994772 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0050  porphobilinogen deaminase  47.44 
 
 		 301 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  47.74 
 
 		 308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0098  porphobilinogen deaminase  31.03 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3002  hydroxymethylbilane synthase  50.64 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00423817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1715  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  46.2 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15190  porphobilinogen deaminase  36.67 
 
 		 377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.229707  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  46.06 
 
 		 309 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  45 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1707  porphobilinogen deaminase  44.72 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0124397 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  47.74 
 
 		 313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2890  porphobilinogen deaminase  48.37 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  40.26 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  52.35 
 
 		 358 aa  127  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2245  porphobilinogen deaminase  43.87 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.53648  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4371  porphobilinogen deaminase  45.91 
 
 		 335 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2377  porphobilinogen deaminase  47.71 
 
 		 310 aa  125  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0089  hydroxymethylbilane synthase  31.13 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  43.11 
 
 		 313 aa  125  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2492  porphobilinogen deaminase  32 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0471431  normal  0.22632 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  48.37 
 
 		 305 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26790  hydroxymethylbilane synthase  46.2 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0549  Hydroxymethylbilane synthase  32.79 
 
 		 306 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.503516  normal  0.484278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2232  porphobilinogen deaminase  46.79 
 
 		 312 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495959  normal  0.0113482 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  46.1 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  29.21 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  31.22 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3664  porphobilinogen deaminase  50.33 
 
 		 334 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0318  porphobilinogen deaminase  34.6 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3450  porphobilinogen deaminase  46.15 
 
 		 526 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.78794 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  42.58 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1226  porphobilinogen deaminase  43.42 
 
 		 309 aa  123  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000455197  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0869  porphobilinogen deaminase  47.1 
 
 		 402 aa  123  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326995  normal  0.554351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  42.41 
 
 		 326 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2179  porphobilinogen deaminase  47.74 
 
 		 327 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.230446  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0700  porphobilinogen deaminase  46.2 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3090  porphobilinogen deaminase  48.34 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  36.4 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  47.47 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3772  porphobilinogen deaminase  30 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.316114  normal  0.0129317 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  45.28 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  46.1 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  44.23 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6729  porphobilinogen deaminase  33.75 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  41.29 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  29.47 
 
 		 309 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1999  porphobilinogen deaminase  48 
 
 		 318 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  decreased coverage  0.0000671123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  48.72 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2468  porphobilinogen deaminase  47.1 
 
 		 328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  43.23 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  28.72 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  28.95 
 
 		 309 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  46.75 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  42.59 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0872  porphobilinogen deaminase  47.74 
 
 		 329 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1813  porphobilinogen deaminase  47.1 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.57316  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0525  porphobilinogen deaminase  41.72 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  47.37 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2429  porphobilinogen deaminase  47.1 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.237637 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  46.2 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  28.5 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  45.57 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2425  porphobilinogen deaminase  47.1 
 
 		 403 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  43.87 
 
 		 339 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5752  porphobilinogen deaminase  47.1 
 
 		 334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1465  porphobilinogen deaminase  45.7 
 
 		 316 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  45.45 
 
 		 312 aa  120  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3568  porphobilinogen deaminase  38.06 
 
 		 321 aa  120  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  43.31 
 
 		 312 aa  120  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  46.15 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0845  porphobilinogen deaminase  47.8 
 
 		 312 aa  120  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.026448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2749  porphobilinogen deaminase  45.57 
 
 		 334 aa  119  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.319663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  28.49 
 
 		 309 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1077  porphobilinogen deaminase  47.1 
 
 		 329 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.941716  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3000  porphobilinogen deaminase  47.1 
 
 		 329 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>