More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0927 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0927  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 373 aa  724    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0460194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3675  porphobilinogen deaminase  60.38 
 
 		 380 aa  424  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1105  porphobilinogen deaminase  60.87 
 
 		 377 aa  424  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.101851  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2014  porphobilinogen deaminase  59.03 
 
 		 378 aa  420  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.898337  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2252  porphobilinogen deaminase  57.98 
 
 		 385 aa  392  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.10668  normal  0.034816 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0691  porphobilinogen deaminase  34.25 
 
 		 303 aa  197  3e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.411778  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1226  porphobilinogen deaminase  35.25 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000455197  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0649  porphobilinogen deaminase  32.13 
 
 		 307 aa  180  4e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.485602  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0570  porphobilinogen deaminase  32.13 
 
 		 307 aa  180  4e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0044  porphobilinogen deaminase  36.84 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0780784  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  34.73 
 
 		 311 aa  172  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  34.34 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  34.54 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  35.85 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  34.06 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  36.24 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  32.88 
 
 		 313 aa  164  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1385  porphobilinogen deaminase  29.72 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0767  porphobilinogen deaminase  30.11 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  34.17 
 
 		 310 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1125  porphobilinogen deaminase  34.95 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0176422  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1048  porphobilinogen deaminase  31.68 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0191591  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  31.15 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0767  porphobilinogen deaminase  32.05 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8325  porphobilinogen deaminase  35.57 
 
 		 317 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0491  porphobilinogen deaminase  29.97 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  34.15 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6800  porphobilinogen deaminase  34.04 
 
 		 320 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.25436 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  34.4 
 
 		 331 aa  158  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  33.15 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  33.51 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  32.68 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  32.87 
 
 		 318 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  33.43 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  38.05 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  31.04 
 
 		 313 aa  152  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  33.33 
 
 		 313 aa  152  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  33.52 
 
 		 313 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2398  porphobilinogen deaminase  33.24 
 
 		 317 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0564467  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  30.75 
 
 		 314 aa  151  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  32.4 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  36.89 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  33.43 
 
 		 309 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  30.87 
 
 		 313 aa  150  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4268  porphobilinogen deaminase  33.8 
 
 		 318 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  31.49 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  33.8 
 
 		 320 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  33.8 
 
 		 320 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2670  porphobilinogen deaminase  33.06 
 
 		 308 aa  149  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000635996 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3437  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 342 aa  149  9e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000351099  decreased coverage  0.00118997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0357  porphobilinogen deaminase  34.24 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03640  porphobilinogen deaminase  28.81 
 
 		 305 aa  149  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4151  porphobilinogen deaminase  33.8 
 
 		 313 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  33.98 
 
 		 310 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4327  porphobilinogen deaminase  33.8 
 
 		 313 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  30.45 
 
 		 318 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  33.7 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  33.7 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  32.22 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  33.7 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  31.78 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3202  porphobilinogen deaminase  34.71 
 
 		 318 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0969809  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  33.7 
 
 		 310 aa  146  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  31.87 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  32.69 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  34.47 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  32.05 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15190  porphobilinogen deaminase  37.81 
 
 		 377 aa  144  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.229707  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  33.7 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  32.88 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  33.42 
 
 		 313 aa  144  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  34.37 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0845  porphobilinogen deaminase  34.25 
 
 		 312 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.026448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2767  porphobilinogen deaminase  35.76 
 
 		 332 aa  143  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00352178  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  30.73 
 
 		 306 aa  142  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3530  porphobilinogen deaminase  37.42 
 
 		 303 aa  142  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2704  porphobilinogen deaminase  32.03 
 
 		 347 aa  142  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  30.52 
 
 		 309 aa  142  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  33.43 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  33.43 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  33.43 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  32.03 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0427  porphobilinogen deaminase  34.44 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.751162  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  30.36 
 
 		 318 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1375  porphobilinogen deaminase  32.68 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  33.61 
 
 		 308 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0118  porphobilinogen deaminase  31.49 
 
 		 318 aa  139  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  34.06 
 
 		 314 aa  139  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1121  porphobilinogen deaminase  31.52 
 
 		 305 aa  139  8.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.878665 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  32.61 
 
 		 316 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  30.83 
 
 		 309 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3772  porphobilinogen deaminase  32.24 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.316114  normal  0.0129317 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2529  porphobilinogen deaminase  32.16 
 
 		 318 aa  139  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0968  porphobilinogen deaminase  48.08 
 
 		 296 aa  138  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.918465  hitchhiker  0.00994772 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2245  porphobilinogen deaminase  32.89 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.53648  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36050  hydroxymethylbilane synthase  34.73 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000727024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  30.43 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  31.79 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1715  porphobilinogen deaminase  44.04 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  48.39 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>