More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0044 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0044  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 307 aa  610  1e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0780784  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  41.7 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1715  porphobilinogen deaminase  44.19 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2890  porphobilinogen deaminase  46.59 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2232  porphobilinogen deaminase  45.14 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495959  normal  0.0113482 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2377  porphobilinogen deaminase  46.18 
 
 		 310 aa  182  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3664  porphobilinogen deaminase  47.13 
 
 		 334 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1226  porphobilinogen deaminase  40.7 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000455197  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  41.49 
 
 		 326 aa  178  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3090  porphobilinogen deaminase  47.48 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1374  porphobilinogen deaminase  43.28 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212718  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  44.66 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  38.06 
 
 		 313 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  40.66 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69450  porphobilinogen deaminase  43.61 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2161  porphobilinogen deaminase  41.2 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1999  porphobilinogen deaminase  46.41 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  decreased coverage  0.0000671123 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 314 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  40.07 
 
 		 314 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  43.11 
 
 		 326 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  41.57 
 
 		 313 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  40.07 
 
 		 304 aa  172  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  39.68 
 
 		 310 aa  172  9e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  40.86 
 
 		 310 aa  172  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  45.45 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  43.4 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1040  porphobilinogen deaminase  43.21 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.866098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6006  porphobilinogen deaminase  42.7 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.254392  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  41.99 
 
 		 312 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0656  porphobilinogen deaminase  40.48 
 
 		 325 aa  169  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  41.2 
 
 		 309 aa  168  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1465  porphobilinogen deaminase  39.69 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  37.54 
 
 		 321 aa  167  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1048  porphobilinogen deaminase  35.88 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0191591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4439  porphobilinogen deaminase  44.8 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1158  porphobilinogen deaminase  43.35 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4145  porphobilinogen deaminase  39.05 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501795  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0764  porphobilinogen deaminase  42.75 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000120999 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  40.98 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3002  hydroxymethylbilane synthase  46.18 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00423817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8325  porphobilinogen deaminase  41.54 
 
 		 317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  39.77 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  39.36 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4133  porphobilinogen deaminase  40.2 
 
 		 309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  43.92 
 
 		 315 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0089  hydroxymethylbilane synthase  39.68 
 
 		 345 aa  165  9e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0093  porphobilinogen deaminase  42.34 
 
 		 309 aa  165  9e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.779159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  37.91 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2966  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  41.3 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  40.52 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  41.38 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  42.11 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4094  porphobilinogen deaminase  40.07 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  39.65 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  39.8 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  41.38 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24400  hydroxymethylbilane synthase  43.12 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2014  porphobilinogen deaminase  36.05 
 
 		 378 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.898337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3674  porphobilinogen deaminase  36.54 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  39.02 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  42.08 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  40.28 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3699  porphobilinogen deaminase  37.41 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3978  porphobilinogen deaminase  41.3 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1105  porphobilinogen deaminase  35.02 
 
 		 377 aa  163  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.101851  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  41 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  41.92 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4000  porphobilinogen deaminase  41.3 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.799289  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  40.34 
 
 		 312 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3901  porphobilinogen deaminase  41.3 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0406  porphobilinogen deaminase  41.95 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0062  porphobilinogen deaminase  41.15 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3587  porphobilinogen deaminase  39.09 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0927  porphobilinogen deaminase  36.84 
 
 		 373 aa  162  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0460194  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0208  porphobilinogen deaminase  42.08 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  42.35 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1200  porphobilinogen deaminase  37.88 
 
 		 321 aa  162  7e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.580193  normal  0.533215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0186  porphobilinogen deaminase  42.08 
 
 		 313 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0388  porphobilinogen deaminase  40.43 
 
 		 315 aa  162  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.895145  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  40.35 
 
 		 313 aa  162  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  38.75 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  39.79 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  40.94 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  40.94 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  40.94 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0256  porphobilinogen deaminase  42.08 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0128  porphobilinogen deaminase  41.31 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47600  porphobilinogen deaminase  40.07 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0211  porphobilinogen deaminase  42.08 
 
 		 313 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  40.13 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0098  porphobilinogen deaminase  38.89 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  39.79 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  40.37 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  36.94 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3202  porphobilinogen deaminase  40.82 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0012  porphobilinogen deaminase  41.58 
 
 		 315 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0691  porphobilinogen deaminase  37.7 
 
 		 303 aa  160  4e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.411778  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0899  porphobilinogen deaminase  35.58 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.28159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>