More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1465 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1465  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 316 aa  637    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1226  porphobilinogen deaminase  58.06 
 
 		 309 aa  365  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000455197  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1125  porphobilinogen deaminase  53.73 
 
 		 270 aa  264  2e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0176422  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0983  porphobilinogen deaminase  49.65 
 
 		 294 aa  248  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188272  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0526  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  48.01 
 
 		 542 aa  246  4e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.654893 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1234  porphobilinogen deaminase  47.02 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.33164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1725  porphobilinogen deaminase  46.69 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  44.07 
 
 		 306 aa  226  5.0000000000000005e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2559  porphobilinogen deaminase  46.3 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  41.91 
 
 		 311 aa  218  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  40.92 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0863  porphobilinogen deaminase  39.55 
 
 		 313 aa  205  7e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0113254  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  40.26 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3354  porphobilinogen deaminase  43.54 
 
 		 308 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  40.2 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3675  porphobilinogen deaminase  37.26 
 
 		 380 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2014  porphobilinogen deaminase  37.23 
 
 		 378 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.898337  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  42.49 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  40.53 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0217  porphobilinogen deaminase  45.99 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000356603  normal  0.0285906 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  39.14 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  37.95 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1105  porphobilinogen deaminase  36.16 
 
 		 377 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.101851  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0178  porphobilinogen deaminase  42 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0266595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  40.13 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  40.68 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  39.03 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0074  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 317 aa  190  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0944  porphobilinogen deaminase  37.97 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700736  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  39.8 
 
 		 315 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  41.11 
 
 		 312 aa  189  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0872  porphobilinogen deaminase  39.55 
 
 		 310 aa  188  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1251  porphobilinogen deaminase  39.3 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3548  porphobilinogen deaminase  38.49 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  38.59 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1544  porphobilinogen deaminase  42.11 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471062  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12370  porphobilinogen deaminase  37.83 
 
 		 313 aa  186  4e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  42.07 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0228  porphobilinogen deaminase  44.44 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0491  porphobilinogen deaminase  37.86 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  41.16 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  42.34 
 
 		 316 aa  185  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1374  porphobilinogen deaminase  42.17 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.212718  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  42.16 
 
 		 314 aa  185  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1289  porphobilinogen deaminase  41.84 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  42.16 
 
 		 314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3987  porphobilinogen deaminase  42.54 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0066  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0447079  normal  0.735502 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2580  porphobilinogen deaminase  39.23 
 
 		 311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2704  porphobilinogen deaminase  42.18 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0845  porphobilinogen deaminase  40.65 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.026448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0652  porphobilinogen deaminase  40.58 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0112  porphobilinogen deaminase  42.22 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1322  porphobilinogen deaminase  41.15 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000625497  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3180  porphobilinogen deaminase  39.55 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  41.43 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4582  porphobilinogen deaminase  39.87 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2791  porphobilinogen deaminase  42.38 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0680  porphobilinogen deaminase  39.45 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2660  porphobilinogen deaminase  42.01 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03640  porphobilinogen deaminase  39.32 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4600  porphobilinogen deaminase  39.94 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1783  porphobilinogen deaminase  38.19 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.370283  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  40.07 
 
 		 311 aa  182  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3202  porphobilinogen deaminase  43.49 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  39.87 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  40.2 
 
 		 312 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0048  porphobilinogen deaminase  41.08 
 
 		 304 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  41.35 
 
 		 309 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  37.26 
 
 		 313 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4309  porphobilinogen deaminase  39.29 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6500  porphobilinogen deaminase  39.33 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4551  porphobilinogen deaminase  40.26 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  38.18 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1454  porphobilinogen deaminase  42.07 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.179158  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3450  porphobilinogen deaminase  42.23 
 
 		 526 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.78794 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4555  porphobilinogen deaminase  39.94 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4361  porphobilinogen deaminase  40.26 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.448902  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31592  predicted protein  40.07 
 
 		 325 aa  180  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.784447 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4696  porphobilinogen deaminase  40.26 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1728  porphobilinogen deaminase  39.03 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0562  porphobilinogen deaminase  42.38 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1762  porphobilinogen deaminase  39.03 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1158  porphobilinogen deaminase  40.07 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.470671  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  39.94 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  40.14 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  42.96 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0237  hydroxymethylbilane synthase  40.78 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0536  porphobilinogen deaminase  39.33 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  42.91 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4016  porphobilinogen deaminase  39.67 
 
 		 313 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602391  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1234  porphobilinogen deaminase  39.03 
 
 		 308 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0387484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  39.33 
 
 		 318 aa  179  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4220  porphobilinogen deaminase  41.44 
 
 		 320 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.782422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4166  porphobilinogen deaminase  41.44 
 
 		 320 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000281942  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1025  porphobilinogen deaminase  39.33 
 
 		 310 aa  178  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0857406  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  36.05 
 
 		 313 aa  179  8e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  40.41 
 
 		 309 aa  179  8e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0198  porphobilinogen deaminase  39.33 
 
 		 313 aa  178  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00764984  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1999  porphobilinogen deaminase  42.45 
 
 		 318 aa  178  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  decreased coverage  0.0000671123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>