81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0814 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  346  9e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  89.47 
 
 		 171 aa  307  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  87.72 
 
 		 171 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  85.71 
 
 		 170 aa  268  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  71.76 
 
 		 171 aa  235  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  72.35 
 
 		 171 aa  230  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  73.37 
 
 		 199 aa  229  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  73.37 
 
 		 199 aa  228  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  67.55 
 
 		 190 aa  223  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  65.27 
 
 		 171 aa  223  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  63.31 
 
 		 172 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  63.31 
 
 		 172 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  63.31 
 
 		 172 aa  218  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  63.47 
 
 		 171 aa  217  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  61.18 
 
 		 170 aa  216  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  59.76 
 
 		 170 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  67.5 
 
 		 172 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  70.97 
 
 		 170 aa  209  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  65.88 
 
 		 171 aa  207  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  64.12 
 
 		 170 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  70.2 
 
 		 170 aa  204  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  70.2 
 
 		 172 aa  205  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  68.12 
 
 		 172 aa  204  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 163 aa  191  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  57.86 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  58.62 
 
 		 165 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  57.93 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  64.63 
 
 		 170 aa  174  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  56.55 
 
 		 165 aa  174  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 165 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 169 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 162 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  31.37 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 171 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 160 aa  42  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  26.05 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  26.05 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  32.56 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 164 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 165 aa  41.2  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 155 aa  41.2  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 172 aa  40.8  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 148 aa  40.8  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 187 aa  40.8  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 164 aa  40.8  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 189 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 159 aa  40.8  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 147 aa  40.8  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 340 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  25.87 
 
 		 169 aa  40.8  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 340 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>