73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4235 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  100 
 
 		 172 aa  349  8.999999999999999e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 172 aa  349  8.999999999999999e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  98.84 
 
 		 172 aa  344  4e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  84.02 
 
 		 170 aa  294  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  82.84 
 
 		 171 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  82.25 
 
 		 171 aa  283  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  72.19 
 
 		 190 aa  251  5.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  79.05 
 
 		 170 aa  246  9e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  68.64 
 
 		 171 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  67.65 
 
 		 172 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  67.35 
 
 		 171 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  74.83 
 
 		 170 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  59.3 
 
 		 171 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  68.48 
 
 		 170 aa  210  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  67.06 
 
 		 170 aa  209  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  74.15 
 
 		 172 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  73.47 
 
 		 172 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  69.39 
 
 		 171 aa  204  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  63.31 
 
 		 170 aa  199  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  61.18 
 
 		 170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  60.92 
 
 		 199 aa  194  7e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  56.69 
 
 		 163 aa  193  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  60.92 
 
 		 199 aa  192  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 165 aa  190  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  65.99 
 
 		 171 aa  189  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  57.42 
 
 		 165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  63.1 
 
 		 170 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  59.31 
 
 		 165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  57.93 
 
 		 165 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  57.93 
 
 		 169 aa  177  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  46.47 
 
 		 172 aa  167  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 164 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  36.08 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  37.36 
 
 		 160 aa  47.8  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 171 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 		 187 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 155 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 155 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  24.64 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  28.28 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  28.28 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  33.05 
 
 		 157 aa  42  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  33.05 
 
 		 157 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 185 aa  41.2  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 313 aa  41.6  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  26.92 
 
 		 312 aa  41.2  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 152 aa  41.2  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  28.95 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>