78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2901 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  351  2.9999999999999997e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  67.1 
 
 		 190 aa  219  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  64.46 
 
 		 170 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  63.46 
 
 		 171 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 170 aa  204  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  63.1 
 
 		 172 aa  204  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  63.1 
 
 		 172 aa  203  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  63.1 
 
 		 172 aa  203  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  64.05 
 
 		 171 aa  202  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  59.17 
 
 		 171 aa  202  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  57.99 
 
 		 171 aa  201  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  63.95 
 
 		 163 aa  201  6e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  65.61 
 
 		 170 aa  186  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  69.39 
 
 		 171 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  55.83 
 
 		 165 aa  185  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  67.35 
 
 		 172 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  68.03 
 
 		 170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  67.35 
 
 		 172 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  67.35 
 
 		 172 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  68.03 
 
 		 170 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  57.83 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  55.21 
 
 		 165 aa  182  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 165 aa  181  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 171 aa  180  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  65.99 
 
 		 199 aa  177  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  58.22 
 
 		 165 aa  177  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  65.99 
 
 		 199 aa  177  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 169 aa  177  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  64.63 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  55.29 
 
 		 170 aa  173  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 186 aa  104  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  40.85 
 
 		 144 aa  48.1  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  45.65 
 
 		 144 aa  47.8  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 152 aa  47.8  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  28.32 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  33 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  33 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  33 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  32.35 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  28.37 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  39.44 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  39.44 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  39.44 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  39.44 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  39.44 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  39.44 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 176 aa  42  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  39.44 
 
 		 144 aa  42  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 		 145 aa  42  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 171 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 147 aa  42  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0635  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.625511  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  31.18 
 
 		 153 aa  41.6  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 144 aa  41.2  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  30.34 
 
 		 144 aa  41.2  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 148 aa  41.2  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  30.34 
 
 		 144 aa  41.2  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 146 aa  40.8  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 157 aa  40.8  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 156 aa  40.8  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 340 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>