48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2663 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 172 aa  347  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  98.84 
 
 		 172 aa  344  4e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  96.51 
 
 		 172 aa  315  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  92.44 
 
 		 171 aa  300  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  92.98 
 
 		 170 aa  294  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  92.98 
 
 		 170 aa  293  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  91.28 
 
 		 170 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  72.67 
 
 		 170 aa  249  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  80.13 
 
 		 190 aa  247  6e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  69.19 
 
 		 172 aa  236  9e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  69.19 
 
 		 172 aa  236  9e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  69.19 
 
 		 172 aa  234  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  72.56 
 
 		 171 aa  234  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  68.82 
 
 		 171 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  69.7 
 
 		 170 aa  229  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  67.76 
 
 		 171 aa  228  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  66.23 
 
 		 171 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  68.71 
 
 		 199 aa  217  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  68.71 
 
 		 199 aa  217  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  65.85 
 
 		 171 aa  209  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  67.08 
 
 		 170 aa  208  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  68.83 
 
 		 171 aa  207  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  65.58 
 
 		 170 aa  197  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  64.83 
 
 		 165 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  57.23 
 
 		 165 aa  194  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 163 aa  194  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  62.76 
 
 		 165 aa  191  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  61.38 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 165 aa  184  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  67.35 
 
 		 170 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 186 aa  91.3  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  39.68 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 148 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 144 aa  42  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 144 aa  42  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  40.96 
 
 		 145 aa  42  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 153 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 149 aa  40.8  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>