65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0765 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  327  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  75.15 
 
 		 165 aa  258  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  75.76 
 
 		 165 aa  257  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  75.15 
 
 		 169 aa  256  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  73.94 
 
 		 165 aa  253  8e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 165 aa  250  7e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  60.37 
 
 		 172 aa  209  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  61.69 
 
 		 190 aa  191  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  58.33 
 
 		 171 aa  185  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  56.88 
 
 		 170 aa  184  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 163 aa  184  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  54.72 
 
 		 171 aa  184  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  54.09 
 
 		 171 aa  184  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  57.42 
 
 		 172 aa  183  9e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  57.42 
 
 		 172 aa  183  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  58.39 
 
 		 170 aa  182  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  56.77 
 
 		 172 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  62.76 
 
 		 170 aa  173  9e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  60.39 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  62.76 
 
 		 170 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  62.76 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  62.76 
 
 		 172 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  62.76 
 
 		 172 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  61.38 
 
 		 171 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  58.44 
 
 		 171 aa  167  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  58.44 
 
 		 199 aa  166  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  58.44 
 
 		 199 aa  166  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 171 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  55.83 
 
 		 170 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 170 aa  162  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  57.24 
 
 		 170 aa  158  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 189 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 186 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 151 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 148 aa  44.3  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 150 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 99 aa  44.3  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 150 aa  43.9  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 151 aa  43.9  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 151 aa  43.9  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  25.87 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  25.87 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  37.89 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 149 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  42 
 
 		 146 aa  42  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 151 aa  42  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 144 aa  40.8  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 340 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 340 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 159 aa  40.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>