65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1541 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
163 aa  331  2e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  57.23 
 
 
171 aa  203  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  59.49 
 
 
171 aa  201  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  60.9 
 
 
190 aa  201  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  56.44 
 
 
170 aa  200  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  55.29 
 
 
170 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  57.32 
 
 
172 aa  194  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  56.69 
 
 
172 aa  193  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  56.69 
 
 
172 aa  193  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  60.54 
 
 
171 aa  192  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  59.86 
 
 
171 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  64.33 
 
 
171 aa  188  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  63.58 
 
 
199 aa  188  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  63.58 
 
 
199 aa  188  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  59.74 
 
 
165 aa  184  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  57.23 
 
 
165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  63.95 
 
 
170 aa  181  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 
170 aa  177  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  58.54 
 
 
172 aa  174  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  61.04 
 
 
171 aa  174  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  58.75 
 
 
170 aa  173  9e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  60.69 
 
 
165 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  59.26 
 
 
170 aa  171  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  56.46 
 
 
165 aa  170  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 
165 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  61.07 
 
 
170 aa  170  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  54.97 
 
 
171 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  60.69 
 
 
169 aa  170  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  61.9 
 
 
172 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  61.9 
 
 
172 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  59.74 
 
 
170 aa  167  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  52.29 
 
 
172 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  47.5 
 
 
164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
189 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
186 aa  97.1  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  37.21 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.77 
 
 
349 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
349 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
340 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
347 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
340 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
326 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
155 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
151 aa  44.3  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  28.67 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  37.74 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  43.14 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
320 aa  41.6  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
173 aa  41.2  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
144 aa  41.2  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
164 aa  41.2  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  30.21 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  30.53 
 
 
144 aa  40.8  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 
155 aa  40.4  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 
144 aa  40.4  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  27.18 
 
 
144 aa  40.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  27.18 
 
 
144 aa  40.4  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  32.77 
 
 
158 aa  40.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>