81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1606 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  100 
 
 		 170 aa  347  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  82.84 
 
 		 171 aa  287  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  82.84 
 
 		 171 aa  286  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  85.71 
 
 		 170 aa  269  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  74.27 
 
 		 171 aa  244  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  72.51 
 
 		 199 aa  227  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  72.51 
 
 		 199 aa  225  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  70.18 
 
 		 171 aa  223  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  63.86 
 
 		 171 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  60.84 
 
 		 190 aa  220  6e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  61.18 
 
 		 172 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  61.18 
 
 		 172 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  61.76 
 
 		 172 aa  218  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  66.23 
 
 		 170 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  65.13 
 
 		 171 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  60.12 
 
 		 170 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  69.08 
 
 		 170 aa  205  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  64.42 
 
 		 172 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  68.21 
 
 		 171 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  66.88 
 
 		 170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  66.23 
 
 		 170 aa  197  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  66.89 
 
 		 172 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  65.58 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 163 aa  187  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  59.31 
 
 		 165 aa  181  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  57.93 
 
 		 165 aa  179  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  57.24 
 
 		 165 aa  177  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 165 aa  174  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  55.29 
 
 		 170 aa  171  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  47.88 
 
 		 169 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  47.9 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 189 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  34.07 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  26.06 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.75 
 
 		 349 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 347 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 141 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 340 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 159 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 340 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 148 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 145 aa  42  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 135 aa  41.6  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 326 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  25.21 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  25.21 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 144 aa  41.2  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 347 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 151 aa  41.2  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 349 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  36.21 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 162 aa  40.8  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  40.8  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 146 aa  40.8  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>