53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1264 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 171 aa  346  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  95.91 
 
 		 171 aa  333  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  89.47 
 
 		 170 aa  286  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  82.84 
 
 		 170 aa  265  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  73.29 
 
 		 171 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  72.94 
 
 		 199 aa  230  8.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  62.79 
 
 		 190 aa  230  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  72.94 
 
 		 199 aa  228  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  78.15 
 
 		 171 aa  224  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  61.99 
 
 		 170 aa  221  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  63.03 
 
 		 171 aa  216  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  61.82 
 
 		 171 aa  215  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  67.35 
 
 		 172 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  67.35 
 
 		 172 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  67.35 
 
 		 172 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  64.63 
 
 		 170 aa  209  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  70.2 
 
 		 171 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  67.76 
 
 		 172 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  68.39 
 
 		 170 aa  207  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  68.87 
 
 		 170 aa  205  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 170 aa  206  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  68.21 
 
 		 172 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  68.21 
 
 		 172 aa  204  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  60.54 
 
 		 163 aa  192  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  61.38 
 
 		 165 aa  187  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  54.72 
 
 		 165 aa  184  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  59.17 
 
 		 170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  56.55 
 
 		 165 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 165 aa  177  7e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 172 aa  177  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 169 aa  174  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 189 aa  88.2  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  26.19 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 162 aa  44.3  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  29.29 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  29.29 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 99 aa  42  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 162 aa  41.6  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 148 aa  40.8  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 151 aa  40.8  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  29.41 
 
 		 146 aa  40.8  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>