47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2238 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  343  7e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  98.82 
 
 		 170 aa  339  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  91.76 
 
 		 171 aa  292  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  91.23 
 
 		 172 aa  288  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  97.42 
 
 		 172 aa  284  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  98.03 
 
 		 172 aa  279  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  95.42 
 
 		 170 aa  271  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  77.92 
 
 		 170 aa  246  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  79.47 
 
 		 190 aa  246  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  73.01 
 
 		 171 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  67.06 
 
 		 172 aa  228  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  70.48 
 
 		 171 aa  229  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  67.06 
 
 		 172 aa  228  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  68.87 
 
 		 171 aa  227  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  67.46 
 
 		 172 aa  227  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  71.24 
 
 		 170 aa  226  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  66.89 
 
 		 171 aa  223  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  67.47 
 
 		 199 aa  210  5.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  67.88 
 
 		 199 aa  210  9e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  69.48 
 
 		 171 aa  206  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  70.2 
 
 		 170 aa  204  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 171 aa  204  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  66.23 
 
 		 170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  65.52 
 
 		 165 aa  195  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  58.75 
 
 		 163 aa  193  8.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  62.76 
 
 		 165 aa  192  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  62.07 
 
 		 165 aa  191  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 165 aa  185  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 169 aa  184  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 165 aa  183  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  68.03 
 
 		 170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 164 aa  121  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 189 aa  94.4  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 186 aa  90.9  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  39.68 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  30.07 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 144 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  39.76 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 164 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 148 aa  40.8  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>