57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0720 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  333  7e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  46.45 
 
 		 171 aa  143  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 170 aa  138  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  49.68 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 190 aa  131  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  45.52 
 
 		 172 aa  130  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  45.52 
 
 		 172 aa  130  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  45.52 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  41.25 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  43.83 
 
 		 170 aa  124  5e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  41.03 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 170 aa  120  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 170 aa  110  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 189 aa  110  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 170 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 170 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  38.69 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 171 aa  103  9e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 186 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  36.73 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 167 aa  44.3  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  29.13 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  30 
 
 		 154 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 144 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  27 
 
 		 144 aa  42  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  27 
 
 		 144 aa  42  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 144 aa  42  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 151 aa  42  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 144 aa  41.2  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 152 aa  41.2  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 157 aa  40.8  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 156 aa  40.8  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  40.8  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 178 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>