53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2113 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 170 aa  342  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  85.16 
 
 		 190 aa  271  5.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  77.98 
 
 		 171 aa  261  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  76.79 
 
 		 171 aa  261  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  75.93 
 
 		 170 aa  253  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  79.05 
 
 		 172 aa  246  8e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  79.05 
 
 		 172 aa  246  8e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  73.96 
 
 		 172 aa  245  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  72.09 
 
 		 172 aa  228  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  72.51 
 
 		 171 aa  228  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  77.92 
 
 		 170 aa  226  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  78.57 
 
 		 172 aa  225  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  79.47 
 
 		 172 aa  224  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  76.25 
 
 		 170 aa  223  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  72.35 
 
 		 170 aa  223  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  61.99 
 
 		 171 aa  221  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  66.23 
 
 		 171 aa  216  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  66.03 
 
 		 171 aa  205  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  67.5 
 
 		 199 aa  204  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  67.5 
 
 		 199 aa  204  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  69.54 
 
 		 171 aa  200  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  64.46 
 
 		 170 aa  199  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  61.18 
 
 		 170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  55.29 
 
 		 163 aa  195  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  60.62 
 
 		 165 aa  195  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  66.23 
 
 		 170 aa  194  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  62.76 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  63.95 
 
 		 165 aa  187  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  62.07 
 
 		 165 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  63.27 
 
 		 169 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  58.39 
 
 		 165 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  51.5 
 
 		 172 aa  167  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 189 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  47.4  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  36.26 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  42.37 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 161 aa  44.7  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  42.17 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 152 aa  42  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 99 aa  41.6  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 186 aa  41.2  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 171 aa  40.8  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 153 aa  40.8  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>