60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1132 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  345  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  73.75 
 
 		 171 aa  256  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  73.29 
 
 		 171 aa  253  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  74.27 
 
 		 170 aa  244  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  74.85 
 
 		 199 aa  241  3e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  75.44 
 
 		 171 aa  240  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  74.85 
 
 		 199 aa  240  7.999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  71.76 
 
 		 170 aa  235  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  63.69 
 
 		 190 aa  231  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  66.03 
 
 		 170 aa  224  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  67.76 
 
 		 172 aa  223  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  67.76 
 
 		 172 aa  223  9e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  66.03 
 
 		 171 aa  223  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  67.76 
 
 		 172 aa  222  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  66.23 
 
 		 171 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  63.46 
 
 		 170 aa  216  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  65.12 
 
 		 172 aa  214  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  72.85 
 
 		 170 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  64.91 
 
 		 171 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  70.13 
 
 		 170 aa  208  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  69.48 
 
 		 170 aa  206  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  70.2 
 
 		 172 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  68.83 
 
 		 172 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 165 aa  196  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  61.04 
 
 		 163 aa  195  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  57.67 
 
 		 165 aa  194  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  56.44 
 
 		 165 aa  186  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  57.83 
 
 		 170 aa  180  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  57.93 
 
 		 165 aa  178  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  57.93 
 
 		 165 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  57.93 
 
 		 169 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 189 aa  91.7  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 195 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  28.67 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 340 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 146 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 340 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 326 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  30.65 
 
 		 179 aa  42  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.88 
 
 		 349 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 349 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 347 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 172 aa  41.2  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 153 aa  40.8  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 141 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>