70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7567 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 171 aa  346  7e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  95.32 
 
 		 171 aa  333  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  83.63 
 
 		 170 aa  294  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  82.84 
 
 		 172 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  82.84 
 
 		 172 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  82.84 
 
 		 172 aa  284  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  76.79 
 
 		 170 aa  261  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  80.39 
 
 		 190 aa  256  9e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  70 
 
 		 172 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  70.76 
 
 		 171 aa  217  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  63.03 
 
 		 171 aa  216  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  73.01 
 
 		 170 aa  216  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  73.89 
 
 		 170 aa  216  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  73.33 
 
 		 170 aa  214  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  75.5 
 
 		 172 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  72.9 
 
 		 172 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  62.18 
 
 		 171 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  65.27 
 
 		 170 aa  204  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  66.03 
 
 		 171 aa  204  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  57.23 
 
 		 163 aa  203  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  63.86 
 
 		 170 aa  201  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  59.63 
 
 		 165 aa  199  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  60.23 
 
 		 199 aa  196  9e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  64.38 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  62.35 
 
 		 171 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  63.95 
 
 		 165 aa  193  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 165 aa  184  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  58.33 
 
 		 165 aa  185  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  63.46 
 
 		 170 aa  185  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 169 aa  184  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 172 aa  169  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 189 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  35.05 
 
 		 146 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  42.37 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  26.05 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  26.05 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  29.91 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 148 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  29.91 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 151 aa  42  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  32.61 
 
 		 160 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 157 aa  42  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 186 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 164 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  25.87 
 
 		 151 aa  41.2  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  27.18 
 
 		 187 aa  40.8  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 163 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 148 aa  40.8  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 157 aa  40.8  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>