49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1115 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
171 aa  347  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  95.91 
 
 
171 aa  333  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  87.72 
 
 
170 aa  280  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  82.84 
 
 
170 aa  265  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  73.75 
 
 
171 aa  234  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  72.35 
 
 
199 aa  230  7.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  72.35 
 
 
199 aa  228  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  61.9 
 
 
190 aa  227  6e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  75.32 
 
 
171 aa  223  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  66.23 
 
 
170 aa  216  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  59.3 
 
 
172 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  63.58 
 
 
171 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  59.3 
 
 
172 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  62.18 
 
 
171 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  59.3 
 
 
172 aa  209  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  62.59 
 
 
170 aa  204  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  68.21 
 
 
171 aa  203  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  66.23 
 
 
172 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  66.45 
 
 
170 aa  202  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  66.89 
 
 
170 aa  201  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  61.54 
 
 
170 aa  201  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  66.23 
 
 
172 aa  201  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  66.23 
 
 
172 aa  200  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  59.86 
 
 
163 aa  192  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 
165 aa  184  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  54.09 
 
 
165 aa  184  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  57.99 
 
 
170 aa  179  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  48.24 
 
 
172 aa  174  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  55.17 
 
 
165 aa  174  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  54.3 
 
 
165 aa  174  7e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  53.1 
 
 
165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  53.1 
 
 
169 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
164 aa  121  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
186 aa  84.3  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 
145 aa  44.7  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  29.29 
 
 
144 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  29.29 
 
 
144 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  25.32 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 
152 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  32.53 
 
 
99 aa  42  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  29.67 
 
 
146 aa  42  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
173 aa  41.6  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
162 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
148 aa  40.8  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.187738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>