48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0936 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 172 aa  351  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  61.39 
 
 		 165 aa  213  7e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  59.76 
 
 		 165 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  60.37 
 
 		 165 aa  209  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  59.88 
 
 		 169 aa  205  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  60.37 
 
 		 165 aa  204  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  60.98 
 
 		 165 aa  204  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  48.82 
 
 		 171 aa  177  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  48.24 
 
 		 171 aa  174  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 		 172 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  50.89 
 
 		 190 aa  171  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  53.21 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  51.5 
 
 		 170 aa  167  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  46.47 
 
 		 172 aa  167  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  46.47 
 
 		 172 aa  167  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 171 aa  167  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 170 aa  167  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 171 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  55.19 
 
 		 199 aa  160  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  51.5 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  52.41 
 
 		 172 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 170 aa  157  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  53.55 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  55.86 
 
 		 172 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 170 aa  155  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  55.86 
 
 		 172 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  47.9 
 
 		 170 aa  150  8.999999999999999e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 164 aa  124  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 99 aa  45.1  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  29.17 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  29.17 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  32.63 
 
 		 146 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03440  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.495444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 146 aa  41.6  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 159 aa  41.6  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  31.13 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 146 aa  40.8  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 141 aa  40.8  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>