69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5629 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  344  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  84.02 
 
 		 172 aa  294  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  85.38 
 
 		 171 aa  294  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  84.02 
 
 		 172 aa  294  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  83.63 
 
 		 171 aa  294  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  84.02 
 
 		 172 aa  294  5e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  75.93 
 
 		 170 aa  253  6e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  77.92 
 
 		 190 aa  251  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  68.26 
 
 		 172 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  64.63 
 
 		 171 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  69.68 
 
 		 170 aa  208  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  68.29 
 
 		 171 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  72.55 
 
 		 172 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  71.24 
 
 		 170 aa  207  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  71.24 
 
 		 170 aa  207  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  74.15 
 
 		 172 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  62.59 
 
 		 171 aa  204  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 163 aa  200  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 171 aa  197  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  59.76 
 
 		 170 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  60.12 
 
 		 170 aa  191  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  60.96 
 
 		 165 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  60.93 
 
 		 165 aa  187  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  64.63 
 
 		 199 aa  187  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  64.63 
 
 		 199 aa  187  8e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  63.95 
 
 		 171 aa  186  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 169 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  60.96 
 
 		 165 aa  184  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  56.88 
 
 		 165 aa  184  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 172 aa  167  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 186 aa  91.7  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  38.14 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 155 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 155 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 145 aa  47.8  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 146 aa  47.4  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 152 aa  47.4  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  44.3  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  30 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  38.98 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 152 aa  42  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  47.5 
 
 		 144 aa  42  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1301  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 144 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.630849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 164 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 158 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 151 aa  42  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 176 aa  41.2  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  24.31 
 
 		 156 aa  40.8  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 142 aa  40.8  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  40.8  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0229  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 151 aa  40.8  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  40.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1500  transcriptional regulator, MarR family  26.5 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>