59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4653 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 170 aa  343  8.999999999999999e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  91.28 
 
 		 172 aa  295  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  92.4 
 
 		 171 aa  290  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  91.76 
 
 		 170 aa  283  5.999999999999999e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  91.18 
 
 		 170 aa  281  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  96.03 
 
 		 172 aa  270  7e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  94.12 
 
 		 172 aa  268  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  71.76 
 
 		 170 aa  246  8e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  80.13 
 
 		 190 aa  246  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  70.83 
 
 		 171 aa  240  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  70.59 
 
 		 172 aa  239  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  70.59 
 
 		 172 aa  239  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  70.59 
 
 		 172 aa  239  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  69.05 
 
 		 171 aa  236  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  65.48 
 
 		 171 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  65.29 
 
 		 170 aa  230  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  63.1 
 
 		 171 aa  227  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  72.85 
 
 		 171 aa  213  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 199 aa  211  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  70.97 
 
 		 170 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  67.46 
 
 		 171 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  69.08 
 
 		 170 aa  206  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  66.21 
 
 		 165 aa  199  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  59.87 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  60.9 
 
 		 165 aa  194  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 163 aa  192  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  60.69 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  62.13 
 
 		 170 aa  185  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 169 aa  184  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 165 aa  184  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 189 aa  93.6  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 186 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 163 aa  47.8  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 144 aa  47.8  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 173 aa  46.6  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  39.68 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  24.56 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  24.65 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 334 aa  42  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 340 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 195 aa  41.2  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 340 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 326 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  39.76 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2670  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 147 aa  40.8  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 149 aa  40.8  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>