46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4714 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  71.14 
 
 		 189 aa  228  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 163 aa  97.1  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 170 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 165 aa  91.3  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 170 aa  90.9  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 171 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 		 171 aa  89  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 165 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  37.75 
 
 		 165 aa  86.7  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 165 aa  85.9  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  32.88 
 
 		 172 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  32.88 
 
 		 172 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 172 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 171 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  38.26 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  36.91 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  38.39 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 144 aa  51.2  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1308  transcriptional regulator, MarR family  22.41 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 313 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 148 aa  42  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03142  putative OhrR transcriptional regulator, MarR/EmrR family protein  28.71 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.946678  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 148 aa  42  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 162 aa  41.6  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 164 aa  41.2  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>