62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6831 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  345  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  95.32 
 
 		 171 aa  333  5e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  85.38 
 
 		 170 aa  294  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  82.25 
 
 		 172 aa  283  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  82.25 
 
 		 172 aa  283  7e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  82.84 
 
 		 172 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  77.98 
 
 		 170 aa  261  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  80.52 
 
 		 190 aa  253  7e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  69.41 
 
 		 172 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  61.82 
 
 		 171 aa  215  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  69.01 
 
 		 171 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  71.97 
 
 		 170 aa  213  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  69.7 
 
 		 170 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  75.32 
 
 		 172 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  70.48 
 
 		 170 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  63.58 
 
 		 171 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  74.83 
 
 		 172 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  66.23 
 
 		 171 aa  201  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  59.49 
 
 		 163 aa  201  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  61.85 
 
 		 199 aa  199  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  63.47 
 
 		 170 aa  199  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  64.2 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  60.38 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  65.13 
 
 		 170 aa  194  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 171 aa  193  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  63.45 
 
 		 165 aa  189  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  61.38 
 
 		 165 aa  184  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  58.33 
 
 		 165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  61.38 
 
 		 169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  61.38 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  64.05 
 
 		 170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 172 aa  167  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 164 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 189 aa  98.2  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 186 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  35.05 
 
 		 146 aa  51.6  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 148 aa  44.7  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  42.37 
 
 		 146 aa  44.7  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  26.05 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  26.05 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  42.53 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 157 aa  42  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 147 aa  42  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 149 aa  42  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  30.77 
 
 		 157 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  47.5 
 
 		 144 aa  42  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 144 aa  41.2  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  30.46 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 159 aa  40.8  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 163 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 160 aa  40.8  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 157 aa  40.8  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>