52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1731 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1731  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  335  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.646541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2651  MarR family transcriptional regulator  76.36 
 
 		 165 aa  270  7e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00357574  normal  0.0103699 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0765  transcriptional regulator  73.94 
 
 		 165 aa  253  8e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.323093 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0415  MarR family transcriptional regulator  70.91 
 
 		 165 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0760  MarR family transcriptional regulator  70.3 
 
 		 169 aa  250  6e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2419  MarR family transcriptional regulator  69.7 
 
 		 165 aa  248  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.219339 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0936  MarR family transcriptional regulator  59.76 
 
 		 172 aa  212  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7567  transcriptional regulator, MarR family  63.95 
 
 		 171 aa  193  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  62.76 
 
 		 190 aa  191  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4235  regulatory protein MarR  58.94 
 
 		 172 aa  190  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4605  transcriptional regulator, MarR family  58.94 
 
 		 172 aa  190  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406482  normal  0.560351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4754  transcriptional regulator, MarR family  58.94 
 
 		 172 aa  189  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0660269  normal  0.466515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6831  MarR family transcriptional regulator  63.45 
 
 		 171 aa  189  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.554602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2113  transcriptional regulator, MarR family  62.76 
 
 		 170 aa  189  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5629  MarR family transcriptional regulator  60.96 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  0.0370953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2991  transcriptional regulator, MarR family  65.52 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4653  MarR family transcriptional regulator  66.21 
 
 		 170 aa  180  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.880116  normal  0.395869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1132  MarR family transcriptional regulator  58.9 
 
 		 171 aa  178  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.32782  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1264  transcriptional regulator, MarR family  57.24 
 
 		 171 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172992  normal  0.297931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2626  MarR family transcriptional regulator  64.83 
 
 		 172 aa  177  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1907  MarR family transcriptional regulator  65.52 
 
 		 170 aa  176  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.784208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2238  MarR family transcriptional regulator  65.52 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.256726  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2663  MarR family transcriptional regulator  64.83 
 
 		 172 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.082667  normal  0.922392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2653  MarR family transcriptional regulator  64.83 
 
 		 171 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.307722  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1115  transcriptional regulator, MarR family  54.3 
 
 		 171 aa  174  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.899235 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2532  MarR family transcriptional regulator  64.14 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0760  MarR family transcriptional regulator  64.14 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0755  MarR family transcriptional regulator  64.14 
 
 		 199 aa  171  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1541  MarR family transcriptional regulator  56.46 
 
 		 163 aa  170  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0179662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2901  MarR family transcriptional regulator  59.33 
 
 		 170 aa  161  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.000159643 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1606  exopolysaccharide II synthesis transcriptional activator ExpG  57.93 
 
 		 170 aa  160  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0814  MarR family transcriptional regulator  57.93 
 
 		 170 aa  157  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0720  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24161  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3438  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 189 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4714  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174586 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 161 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 340 aa  43.9  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 326 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 340 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 99 aa  42  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4529  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000513075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2624  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000470188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  25.93 
 
 		 159 aa  40.4  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>