282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0367 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0367  fimbrial chaperone protein  100 
 
 		 252 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.828681  normal  0.687788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0429  fimbrial chaperone protein  97.22 
 
 		 252 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.193885  hitchhiker  0.000207785 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0376  fimbrial chaperone protein  96.83 
 
 		 252 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.187051  normal  0.269695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0369  fimbrial chaperone protein  97.62 
 
 		 252 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0389  fimbrial chaperone protein  95.63 
 
 		 252 aa  447  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0895943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  36.97 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  36.97 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  36.97 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  36.65 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  35 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1663  pili assembly chaperone  33.19 
 
 		 275 aa  128  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.44583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2829  pili assembly chaperone  35.48 
 
 		 314 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.35 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3019  chaperone CupA5  32.87 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  31.8 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  31.8 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  31.8 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  33.05 
 
 		 245 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  33.33 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.11 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  32.86 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  34.51 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  34.07 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  34.51 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  32.51 
 
 		 248 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  31.51 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  31.78 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  31.51 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  32.26 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.02 
 
 		 265 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  32.9 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  30.52 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.42 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  32.74 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  34.76 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  33.19 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  34.76 
 
 		 267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  34.76 
 
 		 267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  34.76 
 
 		 309 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  34.76 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  30.29 
 
 		 251 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  33.19 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  32.88 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  35.43 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  31.3 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  32.88 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0302  pili assembly chaperone  31.14 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.79 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  31.72 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  31.49 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.26 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  29.72 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  30.88 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  30.88 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  30.88 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  29.44 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  31.08 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  29.91 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  29.91 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  29.24 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  29.24 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.95 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  31.88 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  29.24 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  29.24 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.28 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  32.53 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.94 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.37 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  29.79 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  33.33 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.39 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  34.86 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  32.2 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  32.85 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  32.85 
 
 		 216 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  32.85 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  32.85 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  31.22 
 
 		 225 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  29.87 
 
 		 232 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  29.87 
 
 		 232 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  29.87 
 
 		 232 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  29.87 
 
 		 232 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  31.78 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  37.5 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  31.36 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  31.36 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  31.36 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  29.67 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  29.02 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  31.37 
 
 		 229 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  30.91 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  25 
 
 		 234 aa  99.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  29.41 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3022  chaperone CupA2  31.94 
 
 		 248 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  31.91 
 
 		 251 aa  99  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.94 
 
 		 231 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  30.94 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  30.88 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  30.94 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>