273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0302 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0302  pili assembly chaperone  100 
 
 
244 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37000  chaperone CupA5  37.96 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.883088  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1663  pili assembly chaperone  35.54 
 
 
275 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.44583  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59760  putative pili assembly chaperone  34.88 
 
 
238 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000219223  hitchhiker  1.4963800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2276  pili assembly chaperone  35.37 
 
 
246 aa  138  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00485473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2167  pili assembly chaperone  35.37 
 
 
246 aa  138  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000797941  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  34.18 
 
 
244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3019  chaperone CupA5  37.57 
 
 
238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684415  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  34.18 
 
 
244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  34.18 
 
 
272 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2829  pili assembly chaperone  34.75 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1272  gram-negative pili assembly chaperone  32.03 
 
 
229 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4154  pili assembly chaperone  29.82 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.63 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  33.05 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  32.3 
 
 
245 aa  115  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  31.86 
 
 
259 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  31.6 
 
 
245 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  28.39 
 
 
256 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.96 
 
 
266 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  30.77 
 
 
241 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.41 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  29.46 
 
 
249 aa  109  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.19 
 
 
243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  30.57 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  31.68 
 
 
240 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  30.81 
 
 
236 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  31.68 
 
 
245 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  31.28 
 
 
225 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  31.25 
 
 
243 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  29.05 
 
 
266 aa  105  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  31.25 
 
 
243 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.34 
 
 
266 aa  105  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  29.1 
 
 
246 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0299  pili assembly chaperone  32.24 
 
 
242 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  28.5 
 
 
247 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0389  fimbrial chaperone protein  31.51 
 
 
252 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0895943 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0367  fimbrial chaperone protein  30.7 
 
 
252 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.828681  normal  0.687788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0167  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.3 
 
 
248 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  30.09 
 
 
241 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  30.45 
 
 
233 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  29.2 
 
 
241 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0369  fimbrial chaperone protein  30.26 
 
 
252 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0376  fimbrial chaperone protein  30.26 
 
 
252 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.187051  normal  0.269695 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  30.84 
 
 
246 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  30.84 
 
 
246 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37040  chaperone CupA2  29.07 
 
 
248 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256227  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  27.94 
 
 
248 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0170  pili assembly chaperone  28.51 
 
 
243 aa  99.4  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.978477  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  30.84 
 
 
246 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  30.84 
 
 
246 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0429  fimbrial chaperone protein  30.26 
 
 
252 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.193885  hitchhiker  0.000207785 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.8 
 
 
265 aa  99  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.84 
 
 
246 aa  99  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  28.44 
 
 
267 aa  99  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  28.44 
 
 
267 aa  99  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  30.66 
 
 
234 aa  99  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  28.44 
 
 
253 aa  99  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  32.68 
 
 
229 aa  98.6  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  28.44 
 
 
309 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  27.98 
 
 
309 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  28.94 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4043  pili assembly chaperone  28.28 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127913  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  28.57 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0502  pili assembly chaperone  28.28 
 
 
243 aa  96.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  hitchhiker  0.00160128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  27.51 
 
 
231 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  29.11 
 
 
226 aa  95.5  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1148  pili assembly chaperone  29.73 
 
 
248 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.261386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2832  pili assembly chaperone  24.6 
 
 
252 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1628  pili assembly chaperone  29.82 
 
 
263 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254202  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1548  Pili assembly chaperone, N-terminal  29.32 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264488  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1610  pili assembly chaperone  29.46 
 
 
248 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1525  pili assembly chaperone  29.32 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  27.07 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1603  pili assembly chaperone  29.73 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640544  normal  0.23965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  28.86 
 
 
248 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59720  putative pili assembly chaperone  28.89 
 
 
248 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000243417  hitchhiker  1.8850500000000002e-18 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  27.07 
 
 
231 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  27.07 
 
 
231 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  27.07 
 
 
231 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  26.23 
 
 
247 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  27.07 
 
 
231 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  29.03 
 
 
246 aa  92  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  24.78 
 
 
250 aa  91.7  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3925  putative fimbrial assembly chaperone FanE  25.74 
 
 
226 aa  91.7  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4773  pili assembly chaperone  28.9 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.352818 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2656  pili assembly chaperone  31.91 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0266347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1790  pili assembly chaperone  31.91 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0241556  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  26.23 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  27.4 
 
 
227 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  26.64 
 
 
224 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2389  pilus assembly chaperone  26.18 
 
 
226 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  27.4 
 
 
227 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  28.22 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  27.4 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  29.17 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  26.45 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  25.69 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2340  pilus assembly chaperone  25.53 
 
 
226 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.854509  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2497  gram-negative pilus assembly chaperone  25.44 
 
 
226 aa  89.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.171518  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>