More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1177 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1255  cyclic nucleotide phosphodiesterase, putative  74.85 
 
 
509 aa  766    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3334  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  98.39 
 
 
497 aa  1006    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1177  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  100 
 
 
497 aa  1018    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.651177  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3196  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  98.39 
 
 
497 aa  1005    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  83.54 
 
 
498 aa  821    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3190  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  98.39 
 
 
497 aa  1004    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1066  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  78.37 
 
 
508 aa  793    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1138  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  78.16 
 
 
508 aa  792    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1070  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  78.16 
 
 
508 aa  797    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1006  cyclic nucleotide phosphodiesterase, putative  57.57 
 
 
494 aa  551  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1047  GGDEF domain-containing protein  53.94 
 
 
500 aa  508  1e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3510  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  51.62 
 
 
504 aa  508  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1024  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  52.8 
 
 
500 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3340  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  52.58 
 
 
500 aa  496  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2781  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  51.16 
 
 
498 aa  490  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3009  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  56.01 
 
 
492 aa  472  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.606625  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3179  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.48 
 
 
768 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0375  GGDEF domain-containing protein  43.66 
 
 
762 aa  346  7e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93912  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1077  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40 
 
 
765 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.26 
 
 
776 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3178  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.48 
 
 
768 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1192  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  43.24 
 
 
768 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3322  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43 
 
 
775 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3115  putative diguanylate phosphodiesterase  41.06 
 
 
768 aa  323  6e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4061  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.03 
 
 
768 aa  310  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.948422  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2577  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.65 
 
 
722 aa  269  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0996  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.82 
 
 
829 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.846195  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3143  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain  34.3 
 
 
786 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.661256  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01278  Putative signal protein with HAMP, GGDEF and EAL domains  34.93 
 
 
785 aa  265  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0804794  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3740  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.43 
 
 
793 aa  265  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2825  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.92 
 
 
651 aa  265  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0147323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3579  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.71 
 
 
1107 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.269581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8076  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain-like protein  35.83 
 
 
693 aa  263  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01685  predicted signal transduction protein containing a membrane domain, an EAL and a GGDEF domain  36.63 
 
 
729 aa  262  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.87 
 
 
1486 aa  258  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2380  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.95 
 
 
756 aa  257  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1478  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.95 
 
 
740 aa  257  4e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3562  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.15 
 
 
687 aa  254  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.6333  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1106  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.81 
 
 
730 aa  253  6e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148996 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1705  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.9 
 
 
686 aa  253  7e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.584418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.31 
 
 
1508 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2510  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.87 
 
 
826 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.825062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.31 
 
 
1508 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4026  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.31 
 
 
1508 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1227  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.4 
 
 
779 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.148378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3696  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.29 
 
 
747 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031791  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.1 
 
 
1508 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4922  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.73 
 
 
617 aa  251  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.051397 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3360  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.7 
 
 
785 aa  250  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.400189  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0214  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.22 
 
 
816 aa  249  8e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0913  sensory box protein  33.57 
 
 
782 aa  249  8e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3544  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.53 
 
 
774 aa  249  9e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.119443  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2360  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.46 
 
 
603 aa  249  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4309  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.78 
 
 
766 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0409  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 
925 aa  249  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.231334  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  32.89 
 
 
1515 aa  248  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3912  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  35.97 
 
 
1209 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0802  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.78 
 
 
1070 aa  248  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3821  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  36.04 
 
 
1209 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0235394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2682  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.76 
 
 
790 aa  247  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2925  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.44 
 
 
533 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439369  normal  0.12147 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3424  GGDEF domain-containing protein  35.08 
 
 
1502 aa  246  6e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0256  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.13 
 
 
778 aa  246  8e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03720  sensory box GGDEF domain-containing protein  35.07 
 
 
760 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000164821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2728  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.97 
 
 
858 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6026  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.94 
 
 
1109 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1434  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.42 
 
 
716 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.486546  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0311  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.04 
 
 
1504 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3786  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.77 
 
 
755 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0086  PAS:GGDEF  34.51 
 
 
639 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0242  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.78 
 
 
631 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00436408  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1343  EAL and GGDEF domain-containing protein  34.52 
 
 
1274 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.35 
 
 
720 aa  244  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559949  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2945  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.17 
 
 
778 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0192  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.38 
 
 
643 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3633  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.82 
 
 
1504 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0926  sensory box protein  34.83 
 
 
1063 aa  243  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.59 
 
 
1505 aa  243  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1682  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.57 
 
 
958 aa  243  7.999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.532324  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0458  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.93 
 
 
611 aa  243  7.999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4742  RNase II stability modulator  34.84 
 
 
664 aa  242  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.632651  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.75 
 
 
1511 aa  242  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0914  GGDEF domain-containing protein  37.79 
 
 
693 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398639  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0953  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.79 
 
 
694 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479212  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4474  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.79 
 
 
683 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.192175 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0247  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.04 
 
 
890 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1494  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  35.87 
 
 
769 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314319  normal  0.616711 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5146  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.18 
 
 
892 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2620  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.62 
 
 
743 aa  240  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116694  normal  0.658047 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0516  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.41 
 
 
980 aa  240  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.579103  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.54 
 
 
1499 aa  240  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3722  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.05 
 
 
727 aa  239  5.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4493  PAS:GGDEF  34.35 
 
 
972 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.267938  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2220  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.42 
 
 
499 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.462189  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  35.25 
 
 
1228 aa  239  8e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0980  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.24 
 
 
683 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0604  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.12 
 
 
700 aa  239  9e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0532  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  35.1 
 
 
715 aa  239  9e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06202  Putative signal protein with GGDEF and EAL domains  36.78 
 
 
696 aa  239  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.33406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00964  Putative signal protein with GGDEF and EAL domains  36.78 
 
 
696 aa  239  9e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0651645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>