More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4061 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4061  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  100 
 
 
768 aa  1573    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.948422  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3179  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.06 
 
 
768 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1077  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.56 
 
 
765 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3115  putative diguanylate phosphodiesterase  43.17 
 
 
768 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0443843 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3322  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.43 
 
 
775 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3178  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.3 
 
 
768 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1192  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  43.3 
 
 
768 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3909  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.93 
 
 
776 aa  597  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0375  GGDEF domain-containing protein  42.19 
 
 
762 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1240  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.5 
 
 
777 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4208  HAMP domain/GGDEF domain/EAL domain protein  34.19 
 
 
784 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1227  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.51 
 
 
779 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.148378 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01278  Putative signal protein with HAMP, GGDEF and EAL domains  32.98 
 
 
785 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0804794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0256  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.03 
 
 
778 aa  375  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3942  GGDEF  32.78 
 
 
784 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0583241  hitchhiker  0.00556538 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0913  sensory box protein  29.93 
 
 
782 aa  345  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01685  predicted signal transduction protein containing a membrane domain, an EAL and a GGDEF domain  30.99 
 
 
729 aa  338  2.9999999999999997e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0214  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.45 
 
 
816 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1418  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.51 
 
 
777 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3360  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.18 
 
 
785 aa  326  1e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.400189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2945  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.59 
 
 
778 aa  325  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4292  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.99 
 
 
772 aa  317  5e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.832066  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1047  GGDEF domain-containing protein  41.12 
 
 
500 aa  316  9e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3196  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.79 
 
 
497 aa  310  8e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3190  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.79 
 
 
497 aa  310  8e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1177  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.03 
 
 
497 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.651177  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3334  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.53 
 
 
497 aa  308  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1070  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.5 
 
 
508 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1024  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.6 
 
 
500 aa  306  6e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1106  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.88 
 
 
730 aa  305  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.148996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1255  cyclic nucleotide phosphodiesterase, putative  39.41 
 
 
509 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1006  cyclic nucleotide phosphodiesterase, putative  37.33 
 
 
494 aa  302  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2781  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.35 
 
 
498 aa  300  9e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.66 
 
 
498 aa  299  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1066  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.62 
 
 
508 aa  296  9e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1138  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.62 
 
 
508 aa  296  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3143  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain  33.14 
 
 
786 aa  291  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.661256  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3510  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.83 
 
 
504 aa  289  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3340  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.14 
 
 
500 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3009  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.63 
 
 
492 aa  275  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.606625  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1499  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain  37.39 
 
 
854 aa  273  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0164548  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1007  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  35.57 
 
 
853 aa  270  8e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.56 
 
 
720 aa  269  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559949  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2577  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.13 
 
 
722 aa  261  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0113  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.42 
 
 
721 aa  258  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.881722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0996  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.74 
 
 
829 aa  257  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.846195  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3740  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.24 
 
 
793 aa  257  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8076  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain-like protein  35.87 
 
 
693 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4466  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.96 
 
 
670 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00396259  normal  0.48891 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4600  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.96 
 
 
670 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0221313  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4938  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.62 
 
 
1027 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.393519 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2728  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.62 
 
 
858 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0094  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  32.02 
 
 
721 aa  255  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000375041 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3856  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  36.42 
 
 
1216 aa  252  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0953  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.81 
 
 
694 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.479212  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4474  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35 
 
 
683 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.192175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0914  GGDEF domain-containing protein  34.81 
 
 
693 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398639  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2825  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36 
 
 
651 aa  251  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0147323 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2548  sensory box/GGDEF family protein  35.13 
 
 
828 aa  250  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19879e-34 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4144  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  36.14 
 
 
1215 aa  250  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.78 
 
 
1212 aa  250  7e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.4231 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1434  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.92 
 
 
716 aa  250  7e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.486546  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6026  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.83 
 
 
1109 aa  250  8e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4348  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  36.14 
 
 
1215 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2525  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.36 
 
 
693 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2357  sensory box/GGDEF family protein  35.45 
 
 
912 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.14 
 
 
869 aa  249  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1020  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.03 
 
 
702 aa  249  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  35.38 
 
 
1228 aa  248  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7110  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.8 
 
 
694 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0633557 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2533  sensory box/GGDEF family protein  35.45 
 
 
912 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0980  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.87 
 
 
683 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000403216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1867  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.6 
 
 
710 aa  248  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.559225  normal  0.957058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.92 
 
 
826 aa  248  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0247  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.04 
 
 
890 aa  248  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4216  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  35.92 
 
 
1215 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3696  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.45 
 
 
747 aa  247  6e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031791  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.14 
 
 
869 aa  247  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2297  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  35.76 
 
 
1025 aa  247  6.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.93563  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01894  hypothetical protein  35.59 
 
 
663 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00344016  normal  0.44222 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3912  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  35.38 
 
 
1209 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56790  GGDEF domain/EAL domain-containing protein  32.41 
 
 
687 aa  245  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1091  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.93 
 
 
768 aa  245  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.107307  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2757  GGDEF domain/EAL domain protein  35.29 
 
 
703 aa  245  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2272  sensory box/GGDEF family protein  35.71 
 
 
912 aa  244  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3821  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  35.38 
 
 
1209 aa  245  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0235394 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.76 
 
 
1499 aa  244  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4938  putative lipoprotein  32.36 
 
 
686 aa  244  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4532  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.11 
 
 
846 aa  244  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.946946  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2024  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.51 
 
 
692 aa  244  7e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844542  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2664  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.7 
 
 
1063 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.180042  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1614  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.4 
 
 
771 aa  243  9e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0431388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3323  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.51 
 
 
711 aa  242  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.444283  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2486  GGDEF  34.45 
 
 
703 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6367  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  32.48 
 
 
840 aa  242  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03500  diguanylate cyclase (GGDEF) domain-containing protein  34.15 
 
 
893 aa  242  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1577  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.13 
 
 
911 aa  242  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.286617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2716  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.48 
 
 
629 aa  242  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6649  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  35.36 
 
 
871 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829365  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4487  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.75 
 
 
683 aa  241  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0293073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>