130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3748 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3748  ABC-type metal ion transport system ATPase component-like protein  100 
 
 		 229 aa  473  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.671245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.03 
 
 		 504 aa  99.4  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  35.44 
 
 		 585 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1623  helicase domain-containing protein  32.31 
 
 		 502 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  35.4 
 
 		 585 aa  78.2  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  35.62 
 
 		 586 aa  77  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.12 
 
 		 657 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  35.33 
 
 		 469 aa  75.5  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  33.33 
 
 		 583 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  35.85 
 
 		 586 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  35.85 
 
 		 586 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  35.85 
 
 		 586 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  35.85 
 
 		 586 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  35.85 
 
 		 586 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  35.85 
 
 		 586 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  35.85 
 
 		 586 aa  74.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  35.85 
 
 		 586 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  35.46 
 
 		 459 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  36.13 
 
 		 586 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  36.13 
 
 		 586 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  32.58 
 
 		 538 aa  73.2  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  41.13 
 
 		 606 aa  73.6  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  35.03 
 
 		 586 aa  73.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  35.15 
 
 		 585 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  35.15 
 
 		 585 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  35.15 
 
 		 585 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  36.84 
 
 		 586 aa  72.4  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  40.32 
 
 		 607 aa  72.4  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  34.97 
 
 		 475 aa  72.4  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  35.48 
 
 		 586 aa  72.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  35.48 
 
 		 586 aa  72.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  33.76 
 
 		 591 aa  72  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  31.85 
 
 		 583 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  33.55 
 
 		 588 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  37.21 
 
 		 550 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  31.06 
 
 		 574 aa  69.7  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  34.84 
 
 		 586 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  32.47 
 
 		 597 aa  68.6  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  34.78 
 
 		 569 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  35.26 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  36.08 
 
 		 613 aa  66.2  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  32.43 
 
 		 584 aa  66.2  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  29.94 
 
 		 586 aa  65.9  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  32.5 
 
 		 579 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  32.67 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  33.55 
 
 		 616 aa  63.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  32.28 
 
 		 580 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  33.04 
 
 		 545 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  31.85 
 
 		 583 aa  61.6  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  33.04 
 
 		 545 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  34.71 
 
 		 581 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  31.01 
 
 		 545 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  34.4 
 
 		 1058 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  29.87 
 
 		 580 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  31.82 
 
 		 590 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  31.82 
 
 		 590 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  29.75 
 
 		 580 aa  58.9  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  31.82 
 
 		 590 aa  58.9  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  31.41 
 
 		 584 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  31.82 
 
 		 602 aa  58.5  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  31.82 
 
 		 584 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  31.82 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  31.82 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  31.15 
 
 		 706 aa  57  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  38.36 
 
 		 1043 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  31.17 
 
 		 590 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  41.67 
 
 		 643 aa  55.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3708  helicase-like  36.14 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.663  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  30.43 
 
 		 560 aa  55.1  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  35.53 
 
 		 1052 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  45.59 
 
 		 1287 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  36.99 
 
 		 1051 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  36.99 
 
 		 1061 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  35.53 
 
 		 1055 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  35.53 
 
 		 1055 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  35.53 
 
 		 1055 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2792  type III restriction protein res subunit  41.33 
 
 		 678 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0653946  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  36.99 
 
 		 982 aa  52.8  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  30.09 
 
 		 815 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  38.16 
 
 		 1033 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2849  type III restriction enzyme, res subunit  38.46 
 
 		 512 aa  52.4  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  38.16 
 
 		 1033 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  32 
 
 		 773 aa  52.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  34.21 
 
 		 385 aa  51.6  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  41.56 
 
 		 629 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  32.69 
 
 		 967 aa  51.2  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  35.53 
 
 		 1017 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  29.41 
 
 		 560 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  29.41 
 
 		 560 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  29.41 
 
 		 560 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  36.76 
 
 		 1066 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  36.07 
 
 		 1348 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  38.67 
 
 		 987 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  33 
 
 		 813 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  41.94 
 
 		 1077 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  29.41 
 
 		 560 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  29.41 
 
 		 560 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  34.85 
 
 		 952 aa  49.3  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  34.21 
 
 		 1028 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  36.07 
 
 		 1418 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>